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Enregistrement W2101077472 · doi:10.5539/ijb.v6n4p103

Comparison of the Internal Transcribed Spacer (ITS) Regions Between Hybrid and Their Parents in Scallop

2014· article· en· W2101077472 sur OpenAlexvenueno aff
Biao Wu, Aiguo Yang, Jiakun Yan, Wandong Xu, Tao Yu, Jiteng Tian, Zhihong Liu, Liqing Zhou, Xiujun Sun

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Biology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésScallopHeterosisPatinopecten yessoensisInternal transcribed spacerBiologyOffspringGeneticsGeneRibosomal DNARibosomal RNAHybridFisheryBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The remarkable heterosis of the heterozygous F1 derived from Zhikong scallop Chlamys farreri (?) and Japanese scallop Patinopecten yessoensis (?) has been proved during cultured process, and some genetic characteristics analysis have also been conducted using some molecular markers ISSR, SSR, MSAP, and so on. However, no study about the comparison between hybrid offspring and parents based on the nuclear ribosomal DNA internal transcribed spacer (ITS) was explored. In this study, the ITS-1 and ITS-2 of the C. farreri, P. yessoensis and their hybrid were amplified by PCR using specific primers and characteristics of those ITS regions, genetic regularity were analyzed. The results suggested that ITS-2 (334 bp- 352 bp) were a little longer than ITS-1 (241 bp- 256 bp) in length while the average GC content were lower than AT in most individuals, and they all had high genetic variation. Also, the gene flow between the hybrid and female parents were higher than that of hybrid and male parents. Our data implied a commonality that the ITS regions of offspring shared more similarity with that of female parents. This data in the present investigation will help for further studies in heterosis mechanism and utilization of hybrid scallop in China.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,302
Écart entre enseignants0,277 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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