Cryptanaerobacter phenolicus gen. nov., sp. nov., an anaerobe that transforms phenol into benzoate via 4-hydroxybenzoate
Notice bibliographique
Résumé
An anaerobic bacterium that transforms phenol and 4-hydroxybenzoate (4-OHB) into benzoate, strain LR7.2T, was isolated from a culture originating from a mixture of swamp water, sewage sludge, swine waste and soil. Cells of strain LR7.2T are Gram-positive short rods (1 x 2 microm) that are electron-dense when observed by electron microscopy. The optimum pH and temperature for growth and transformation activity of 4-OHB are 7.5-8.0 and 30-37 degrees C, respectively. The bacterium does not use sulphate, thiosulphate, nitrate, nitrite, FeCl3, fumarate or arsenate as an electron acceptor. It does not normally use sulphite, although stimulation of growth and 4-OHB transformation activity at a low concentration (up to 2 mM) has been reported previously under different culture conditions. The presence of 4-OHB or phenol is essential for growth; transformation of 4-OHB or phenol into benzoate is used to produce energy for growth. Using [6D]-phenol, 4-OHB was shown to be an intermediate in the transformation of phenol into benzoate. No spore was observed. The bacterium has a DNA G+C content of 51 mol% and its major membrane fatty acid is anteiso-C(15 : 0). The 16S rRNA gene sequence of strain LR7.2T shows only 90 % similarity to its closest relative (Pelotomaculum thermopropionicum). From these results, a new taxon is proposed: Cryptanaerobacter phenolicus gen. nov., sp. nov. The type strain is LR7.2T (=ATCC BAA-820T=DSM 15808T).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».