Lack of detectable genetic differentiation between den populations of the Prairie Rattlesnake (<i>Crotalus</i><i>viridis</i>) in a fragmented landscape
Notice bibliographique
Résumé
Numerous studies have reported genetic fragmentation of species whose habitat has been modified by roads and other anthropogenic features, but it is still not clear how most species respond to roads and whether genetic effects can be detected over a limited number of generations. We used road-crossing models and population genetic analysis (based on microsatellite loci) to make inferences about functional connectivity between populations of the Prairie Rattlesnake (Crotalus viridis (Rafinesque, 1818)) on opposite sides of the Trans-Canada Highway near Medicine Hat (Alberta, Canada). The road-crossing model predicted a high probability of mortality while crossing the Trans-Canada Highway. However, model-based genetic clustering methods (STRUCTURE and BAPS) did not detect structure; a nonmodel-based clustering method (DAPC) found structure, but most groups consisted of individuals captured throughout the study area. Estimates of effective population size were immeasurably large and power to detect genic differentiation was diminished if the effective size exceeded 500; this reduction in power was intensified when the number of loci was reduced (from eight to five to account for null alleles). Our results corroborate accounts of long-distance migration by this species and indicate that genetic fragmentation may not be easily detectable over this spatial and temporal scale.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».