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Enregistrement W2101213180 · doi:10.1128/jb.187.10.3359-3368.2005

Defective O-Antigen Polymerization in<i>tolA</i>and<i>pal</i>Mutants of<i>Escherichia coli</i>in Response to Extracytoplasmic Stress

2005· article· en· W2101213180 sur OpenAlexaff
Enrique D. Vinés, Cristina L. Marolda, Aran Balachandran, Miguel A. Valvano

Notice bibliographique

RevueJournal of Bacteriology · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEscherichia coli research studies
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMutantEscherichia coliBiologyEnterobacteriaceaeLipopolysaccharideSalmonella entericaGeneComplementationlac operonKlebsiella pneumoniaeMicrobiologyMolecular biologyAntigenBiochemistryGeneticsImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We have previously shown that the TolA protein is required for the correct surface expression of the Escherichia coli O7 antigen lipopolysaccharide (LPS). In this work, delta tolA and delta pal mutants of E. coli K-12 W3110 were transformed with pMF19 (encoding a rhamnosyltransferase that reconstitutes the expression of O16-specific LPS), pWQ5 (encoding the Klebsiella pneumoniae O1 LPS gene cluster), or pWQ802 (encoding the genes necessary for the synthesis of Salmonella enterica O:54). Both DeltatolA and delta pal mutants exhibited reduced surface expression of O16 LPS as compared to parental W3110, but no significant differences were observed in the expression of K. pneumoniae O1 LPS and S. enterica O:54 LPS. Therefore, TolA and Pal are required for the correct surface expression of O antigens that are assembled in a wzy (polymerase)-dependent manner (like those of E. coli O7 and O16) but not for O antigens assembled by wzy-independent pathways (like K. pneumoniae O1 and S. enterica O:54). Furthermore, we show that the reduced surface expression of O16 LPS in delta tolA and delta pal mutants was associated with a partial defect in O-antigen polymerization and it was corrected by complementation with intact tolA and pal genes, respectively. Using derivatives of W3110 delta tolA and W3110 delta pal containing lacZ reporter fusions to fkpA and degP, we also demonstrate that the RpoE-mediated extracytoplasmic stress response is upregulated in these mutants. Moreover, an altered O16 polymerization was also detected under conditions that stimulate RpoE-mediated extracytoplasmic stress responses in tol+ and pal+ genetic backgrounds. A Wzy derivative with an epitope tag at the C-terminal end of the protein was stable in all the mutants, ruling out stress-mediated proteolysis of Wzy. We conclude that the absence of TolA and Pal elicits a sustained extracytoplasmic stress response that in turn reduces O-antigen polymerization but does not affect the stability of the Wzy O-antigen polymerase.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,645
Score d'incertitude au seuil0,581

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations70
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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