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Enregistrement W2101235685 · doi:10.1128/cdli.9.3.698-703.2002

Importance of M-Protein C Terminus as Substrate Antigen for Serodetection of Equine Arteritis Virus Infection

2002· article· en· W2101235685 sur OpenAlexafffund
Celia Jerónimo, Denis Archambault

Notice bibliographique

RevueClinical and Vaccine Immunology · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueAnimal Virus Infections Studies
Établissements canadiensUniversité du Québec à Montréal
Organismes subventionnairesUniversité du Québec à Montréal
Mots-clésBiologyFusion proteinMolecular biologyAntigenicityProtein A/GEpitopeVirologyArterivirusAntigenComplementary DNAPeptide sequenceEctodomainRecombinant DNAAntibodyAmino acidBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Equine arteritis virus (EAV), an enveloped positive-stranded RNA virus, is the prototype of the arterivirus group. In a previous paper (A. Kheyar, S. Martin, G. St.-Laurent, P. J. Timoney, W. H. McCollum, and D. Archambault, Clin. Diagn. Lab. Immunol. 4:648-652, 1997), we have shown that the unglycosylated membrane (M) protein, which is composed of 162 amino acids (aa), is a major target of equine antibody to EAV. In order to determine the antigenic regions of the M protein, the cDNA encoding the M protein of EAV was inserted into the procaryotic expression vector pGEX-4T-1 to produce recombinant glutathione S-transferase-M fusion protein. Various deletion mutant clones, which covered the entire sequence of the M protein, were then generated by inverse PCR and expressed in Escherichia coli to examine, by a Western blot assay, the antigenic reactivity of the clone-derived truncated M proteins with sera from horses either experimentally or naturally infected with EAV. Deletion of the hydrophobic N-terminal 87 aa did not abolish immune reactivity of the protein with serum antibodies to EAV, thereby demonstrating the antigenicity of the C-terminal region (aa 88 to 162) of the M protein. Further truncations of the M-protein C-terminal domain defined particular linear epitope-containing amino acid sequence regions. However, only the M-protein C-terminal region was readily recognized by all EAV-specific horse antisera tested in this study. Based on these findings, only the M-protein C-terminal polypeptide composed of aa 88 to 162 is necessary to identify horse serum antibodies specific to the EAV M protein. Thus, this polypeptide might be useful for serodetection of EAV-infected animals.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,065
Tête enseignante GPT0,307
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2002
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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