Role of an Alginate Lyase for Alginate Transport in Mucoid <i>Pseudomonas aeruginosa</i>
Notice bibliographique
Résumé
The opportunistic pathogen Pseudomonas aeruginosa secretes a capsule-like polysaccharide called alginate that is important for evasion of host defenses, especially during chronic pulmonary disease of patients with cystic fibrosis (CF). Most proteins for alginate biosynthesis are encoded by the 12-gene algD operon. Interestingly, this operon also encodes AlgL, a lyase that degrades alginate. Mutants lacking AlgG, AlgK, or AlgX, also encoded by the operon, synthesize alginate polymers that are digested by the coregulated protein AlgL. We examined the phenotype of an DeltaalgL mutation in the highly mucoid CF isolate FRD1. Generating a true DeltaalgL mutant was possible only when the algD operon was under the control of a LacI(q)-repressed trc promoter. Upon induction of alginate production with isopropyl-beta-D-thiogalactopyranoside, the DeltaalgL mutant cells were lysed within a few hours. Electron micrographs of the DeltaalgL mutant showed that alginate polymers accumulated in the periplasm, which ultimately burst the bacterial cell wall. The requirement of AlgL in an alginate-overproducing strain led to a new model for alginate secretion in which a multiprotein secretion complex (or scaffold, that includes AlgG, AlgK, AlgX, and AlgL) guides new polymers through the periplasm for secretion across the outer membrane. In this model, AlgL is bifunctional with a structural role in the scaffold and a role in degrading free alginate polymers in the periplasm.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».