Distribution of selected virulence genes and antibiotic resistance in Enterococcus species isolated from the South Nation River drainage basin, Ontario, Canada
Notice bibliographique
Résumé
AIMS: Isolate and characterize water enterococci from the South Nation River drainage basin, an area dominated by agriculture. METHODS AND RESULTS: A total of 1558 enterococci were isolated from 204 water samples from the South Nation River obtained over a 3-year period. PCR was used to identify isolates to the species level and characterize them for carriage of 12 virulence determinants. Antibiotic resistance was evaluated phenotypically. Enterococcus faecalis (36·4%), Enterococcus faecium (9·3%) and Enterococcus durans (8·5%) were the major enterococci species isolated. Enterococci carrying more than two virulence determinants were more frequently detected in the summer (59·6%) than in other seasons (≤ 37·6%). Very few isolates (≤ 2·0%) were resistant to category I antibiotics ciprofloxacin and vancomycin. CONCLUSIONS: Comparison of major water enterococci species with major faecal enterococci species obtained from various host groups (human, domesticated mammals and birds, wildlife) in this drainage basin suggest that water enterococci may have varied faecal origins. The low level of antibiotic resistance among enterococci suggests that dispersion of antibiotic resistance via waterborne enterococci in this watershed is not significant. SIGNIFICANCE AND IMPACT OF THE STUDY: The data obtained in this study suggests that water enterococci in the SNR have a faecal origin and that their potential impact on public health regarding antibiotic resistance and virulence determinants is minimal.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».