A cancer derived mutation in the Retinoblastoma gene with a distinct defect for LXCXE dependent interactions
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: The interaction between viral oncoproteins such as Simian virus 40 TAg, adenovirus E1A, and human papilloma virus E7, and the retinoblastoma protein (pRB) occurs through a well characterized peptide sequence, LXCXE, on the viral protein and a well conserved groove in the pocket domain of pRB. Cellular proteins, such as histone deacetylases, also use this mechanism to interact with the retinoblastoma protein to repress transcription at cell cycle regulated genes. For these reasons this region of the pRB pocket domain is thought to play a critical role in growth suppression. RESULTS: In this study, we identify and characterize a tumor derived allele of the retinoblastoma gene (RB1) that possesses a discrete defect in its ability to interact with LXCXE motif containing proteins that compromises proliferative control. To assess the frequency of similar mutations in the RB1 gene in human cancer, we screened blood and tumor samples for similar alleles. We screened almost 700 samples and did not detect additional mutations, indicating that this class of mutation is rare. CONCLUSIONS: Our work provides proof of principal that alleles encoding distinct, partial loss of function mutations in the retinoblastoma gene that specifically lose LXCXE dependent interactions, are found in human cancer.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».