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Enregistrement W2101528346 · doi:10.1111/j.1399-0039.2011.01670.x

Differential major histocompatibility complex class I chain‐related A allele associations with skin and joint manifestations of psoriatic disease

2011· article· en· W2101528346 sur OpenAlexafffund
Remy A. Pollock, Vinod Chandran, John Barrett, Lihi Eder, Fawnda Pellett, Christopher M. K. L. Yao, Marsel Lino, S. Shanmugarajah, Vernon T. Farewell, Dafna D. Gladman

Notice bibliographique

RevueTissue Antigens · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Cell Function and Interaction
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilCanadian Institutes of Health ResearchKrembil FoundationBritish Heart Foundation
Mots-clésAlleleMajor histocompatibility complexGeneticsDiseaseImmunologyCD74BiologyMedicineDermatologyMHC class IGenePathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

About 30% of patients with psoriasis have psoriatic arthritis (PsA), an inflammatory arthritis that can affect both axial and peripheral joints. Major histocompatibility complex class I chain-related A (MICA) alleles have previously been shown to be associated with PsA; however it is unclear whether there is a differential association of MICA alleles with skin and joint manifestations of PsA. Here, we describe a case-control study that aims to validate previously reported MICA allele associations with PsA and determine whether MICA alleles differentiate patients with PsA from those with psoriasis without PsA. Two hundred forty-nine unrelated Caucasian PsA patients, 243 psoriasis patients without arthritis, and 248 healthy controls were genotyped for 55 MICA alleles using PCR-SSP, and for human leucocyte antigen (HLA)-B and HLA-C alleles by PCR-SSO reverse line blot. Allele frequencies were calculated and logistic regressions were performed, adjusting for HLA-B and HLA-C alleles previously shown to be associated with psoriasis and/or PsA. Several MICA alleles were associated with psoriatic disease, PsA, and psoriasis compared with controls, and PsA compared with psoriasis in univariate analyses. Haplotype analysis showed evidence of strong linkage disequilibrium (LD) between PsA and psoriasis risk alleles of HLA-C, HLA-B, and MICA. After adjusting for significant HLA-B and HLA-C alleles in multivariate analyses, MICA*016 remained significantly associated with psoriasis [odds ratio (OR) = 5.5, P = 0.008]. MICA*00801 homozygosity was associated with susceptibility to PsA when compared with patients with psoriasis alone (OR = 2.26, P = 0.009). We conclude that most MICA allele associations with psoriasis and PsA are dependent on LD with HLA-B and HLA-C risk alleles. Independent of HLA, only MICA*016 influences the risk of developing psoriasis without arthritis, and homozygosity for MICA*00801 increases the risk of developing PsA in patients with psoriasis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations41
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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