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Enregistrement W2101577087 · doi:10.1093/hmg/ddt675

Genetic determinants of heel bone properties: genome-wide association meta-analysis and replication in the GEFOS/GENOMOS consortium

2014· review· en· W2101577087 sur OpenAlex
Alireza Moayyeri, Yi‐Hsiang Hsu, David Karasik, Karol Estrada, Su‐Mei Xiao, Carrie M. Nielson, Priya Srikanth, Sylvie Giroux, Scott G. Wilson, Hou‐Feng Zheng, Albert V. Smith, Stephen R. Pye, Paul Leo, Alexander Teumer, Jooyeon Hwang, Claes Ohlsson, Fiona E. McGuigan, Ryan L. Minster, Caroline Hayward, José M. Olmos, Leo‐Pekka Lyytikäinen, Joshua R. Lewis, Karin M. A. Swart, Laura Masi, Christopher Oldmeadow, Sulin Cheng, Natasja M. van Schoor, Nicholas C. Harvey, Marcin Kruk, Fabiola Del Greco M, Wilmar Igl, Olivia Trummer, Efi Grigoriou, Robert Luben, Ching‐Ti Liu, Yanhua Zhou, Ling Oei, Carolina Medina‐Gómez, Joseph M. Zmuda, Greg Tranah, Suzanne J. Brown, Frances M. K. Williams, Nicole Soranzo, Jóhanna Jakobsdóttir, Kristín Siggeirsdóttir, Kate L. Holliday, Anke Hannemann, Min Jin Go, Melissa García, Ozren Polašek, Marika Laaksonen, Kun Zhu, Anke W. Enneman, Mark McEvoy, Roseanne Peel, Pak C. Sham, Maciej Jaworski, Åsa Johansson, Andrew A. Hicks, Paweł Płudowski, Rodney J. Scott, R.A.M. Dhonukshe-Rutten, Nathalie van der Velde, Mika Kähönen, Jorma Viikari, Harri Sievänen, Olli T. Raitakari, Jesús González-Macı́as, José L. Hernández, Dan Mellström, Östen Ljunggren, Yoon Shin Cho, Uwe Völker, Matthias Nauck, Georg Homuth, Henry Völzke, Robin Haring, Matthew A. Brown, Eugène McCloskey, Geoffrey C. Nicholson, Richard Eastell, John A. Eisman, Graeme Jones, Ian R. Reid, Elaine Dennison, John D. Wark, Steven Boonen, Dirk Vanderschueren, Frederick C. W. Wu, Thor Aspelund, J. Brent Richards, Doug C. Bauer, Albert Hofman, Kay‐Tee Khaw, George Dedoussis, Barbara Obermayer‐Pietsch, Ulf Gyllensten, Peter P. Pramstaller, R Lorenc, Cyrus Cooper, A W Kung, Paul Lips, Markku Alén, John Attia, Maria Luisa Brandi, C.P.G.M. de Groot, Terho Lehtimäki, José A. Riancho, Harry Campbell, Tamara B. Harris, Kristina Åkesson, Magnus K. Karlsson, Jong‐Young Lee, Henri Wallaschofski, Emma L. Duncan, Terence W O’Neill, Vilmundur Guðnason, Timothy D. Spector, François Rousseau, Eric Orwoll, Steven R. Cummings, Fernando Rivadeneira, André G. Uitterlinden, Richard L. Prince, Douglas P. Kiel, J. Reeve, Stephen K. Kaptoge

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueHuman Molecular Genetics · 2014
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTendon Structure and Treatment
Établissements canadiensUniversité LavalMcGill UniversityCentre hospitalier universitaire de Québec
Organismes subventionnairesNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesNational Institute on AgingNovo Nordisk FondenBritish Heart FoundationMedical Research CouncilNational Institute for Health and Care Research
Mots-clésSingle-nucleotide polymorphismBiologyHeelGenome-wide association studyCalcaneusOsteoporosisGeneticsGenetic associationBone densityLocus (genetics)GeneGenotypeEndocrinologyAnatomy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Quantitative ultrasound of the heel captures heel bone properties that independently predict fracture risk and, with bone mineral density (BMD) assessed by X-ray (DXA), may be convenient alternatives for evaluating osteoporosis and fracture risk. We performed a meta-analysis of genome-wide association (GWA) studies to assess the genetic determinants of heel broadband ultrasound attenuation (BUA; n = 14 260), velocity of sound (VOS; n = 15 514) and BMD (n = 4566) in 13 discovery cohorts. Independent replication involved seven cohorts with GWA data (in silico n = 11 452) and new genotyping in 15 cohorts (de novo n = 24 902). In combined random effects, meta-analysis of the discovery and replication cohorts, nine single nucleotide polymorphisms (SNPs) had genome-wide significant (P < 5 × 10(-8)) associations with heel bone properties. Alongside SNPs within or near previously identified osteoporosis susceptibility genes including ESR1 (6q25.1: rs4869739, rs3020331, rs2982552), SPTBN1 (2p16.2: rs11898505), RSPO3 (6q22.33: rs7741021), WNT16 (7q31.31: rs2908007), DKK1 (10q21.1: rs7902708) and GPATCH1 (19q13.11: rs10416265), we identified a new locus on chromosome 11q14.2 (rs597319 close to TMEM135, a gene recently linked to osteoblastogenesis and longevity) significantly associated with both BUA and VOS (P < 8.23 × 10(-14)). In meta-analyses involving 25 cohorts with up to 14 985 fracture cases, six of 10 SNPs associated with heel bone properties at P < 5 × 10(-6) also had the expected direction of association with any fracture (P < 0.05), including three SNPs with P < 0.005: 6q22.33 (rs7741021), 7q31.31 (rs2908007) and 10q21.1 (rs7902708). In conclusion, this GWA study reveals the effect of several genes common to central DXA-derived BMD and heel ultrasound/DXA measures and points to a new genetic locus with potential implications for better understanding of osteoporosis pathophysiology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,539
Score d'incertitude au seuil0,995

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,082
Tête enseignante GPT0,343
Écart entre enseignants0,262 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle