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Enregistrement W2101601645 · doi:10.1136/gutjnl-2014-308398

Interferon gamma receptor 2 gene variants are associated with liver fibrosis in the general population: the Rotterdam Study

2014· letter· en· W2101601645 sur OpenAlexaff
Elisabeth P.C. Plompen, Bettina E. Hansen, Jeoffrey Schouten, Sarwa Darwish Murad, Daan W. Loth, Willem Pieter Brouwer, Aaron Isaacs, Pavel Taimr, Albert Hofman, Cornelia M. van Duijn, André G. Uitterlinden, Bruno H. Stricker, Frank W.G. Leebeek, Harry L.A. Janssen

Notice bibliographique

RevueGut · 2014
Typeletter
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLiver Disease Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTransient elastographySingle-nucleotide polymorphismRotterdam StudyPopulationFibrosisMedicineGenotypingLiver diseaseSNPChronic liver diseaseInternal medicineBioinformaticsImmunologyGenotypeProspective cohort studyBiologyLiver fibrosisGeneticsGeneCirrhosis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Dear Editor, Increasing evidence suggests that genetic factors play a role in the multifactorial aetiology of liver fibrosis. In their recent paper, Zhao et al 1 support this by describing the role of the Jnk1 gene in liver fibrogenesis. Previously, the role of other inflammatory-related genes in the development of liver fibrosis has been described in patients with chronic liver diseases. In patients with chronic hepatitis C, Nalpas et al 2 demonstrated a strong association between single nucleotide polymorphisms (SNP) in the interferon gamma receptor 2 ( IFNGR2 ) gene and progression of liver fibrosis. The role of interferon gamma in liver fibrogenesis has been reported before, but the precise mechanism of this effect has not yet been fully elucidated.3 ,4 Currently, it is not known whether the genetic variants in the IFNGR2 gene also influence liver fibrogenesis in individuals without liver disease. Therefore, we aimed to study the association between the IFNGR2 SNPs and liver fibrosis in the general population. For this purpose, we assessed the extent of liver fibrosis non-invasively by measuring liver stiffness (LS) using transient elastography (TE) (Fibroscan, Echosens) in 1059 participants of the Rotterdam study. Genotyping in these, almost exclusively Caucasian (99.6%) participants was performed with the Infinium II HumanHap 550K Genotyping Bead-Chip V.3 (Illumina, San Diego, California, USA). The Rotterdam Study is a large, ongoing, prospective population-based cohort study in subjects aged ≥55 years in …

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,579
Score d'incertitude au seuil0,719

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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