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Enregistrement W2101642277 · doi:10.1111/j.1365-294x.2005.02807.x

Rapid parallel evolutionary changes of gene transcription profiles in farmed Atlantic salmon

2005· article· en· W2101642277 sur OpenAlexaffabout
Christian Roberge, Sigurd Einum, Helga Guderley, Louis Bernatchez

Notice bibliographique

RevueMolecular Ecology · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and phenotypic traits in livestock
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyGeneGene flowGeneticsEvolutionary biologyZoologyGenetic variation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Farmed salmon strains have been selected to improve growth rates as well as other traits of commercial interest but the 2 million farmed salmon escaping annually may enhance the risk of extinction of wild populations through genetic and ecological interactions. Here, we compare the transcription profiles of 3557 genes in the progeny of farmed and wild Atlantic salmon from Norway and Canada grown in controlled conditions, and demonstrate that five to seven generations of artificial selection led to heritable changes in gene transcription profiles, the average magnitude of the differences being 25% and 18% for at least 1.4% and 1.7% of the expressed genes in juvenile salmon from Norway and Canada, respectively. Moreover, genes showing significant transcription profile differences in both farmed strains (16%) all exhibited parallel changes. These findings, along with the identification of several genes whose expression profiles were modified through artificial selection, provide new insights into the molecular basis of parallel evolution, and suggest how gene flow from farmed escapees may affect the genetic integrity of wild populations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,666
Score d'incertitude au seuil0,653

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations135
Publié2005
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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