Exon 3 <i>β-catenin</i> mutations are specifically associated with colorectal carcinomas in hereditary non-polyposis colorectal cancer syndrome
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND AND AIMS: Activating beta-catenin mutations in exon 3 have been implicated in colorectal tumorigenesis. Although reports to the contrary exist, it has been suggested that beta-catenin mutations occur more often in microsatellite unstable (MSI+) colorectal carcinomas, including hereditary non-polyposis colorectal cancer (HNPCC), as a consequence of defective DNA mismatch repair. We have analysed 337 colorectal carcinomas and adenomas, from both sporadic cases and HNPCC families, to provide an accurate assessment of beta-catenin mutation frequency in each tumour type. METHODS: Direct sequencing of exon 3 of beta-catenin. RESULTS: Mutations were rare in sporadic (1/83, 1.2%) and HNPCC adenomas (1/37, 2.7%). Most of the sporadic adenomas analysed (80%) were small (<1 cm), and our data therefore differ from a previous report of a much higher mutation frequency in small adenomas. No oncogenic beta-catenin mutations were identified in 34 MSI+ and 78 microsatellite stable (MSI-) sporadic colorectal cancers but a raised mutation frequency (8/44, 18.2%) was found in HNPCC cancers; this frequency was significantly higher than that in HNPCC adenomas (p=0.035) and in both MSI- (p<0.0001) and MSI+ (p=0.008) sporadic cancers. Mutations were more common in higher stage (Dukes' stages C and D) cancers (p=0.001). CONCLUSION: Exon 3 beta-catenin mutations are associated specifically with malignant colorectal tumours in HNPCC; mutations appear not to result directly from deficient mismatch repair. Our data provide evidence that the genetic pathways of sporadic MSI+ and HNPCC cancers may be divergent, and indicate that mutations in the HNPCC pathway of colorectal tumorigenesis may be determined by selection, not simply by hypermutation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».