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Enregistrement W2101726394 · doi:10.1111/j.1537-2995.2009.02569.x

Feasibility study of a screening assay that identifies the abnormal prion protein PrP<sup>TSE</sup> in plasma: initial results with 20,000 samples

2010· article· en· W2101726394 sur OpenAlexfundno aff
Philippe Guntz, Christine Walter, Patricia Schosseler, Pascal Morel, Joliette Coste, Jean‐Pierre Cazenave

Notice bibliographique

RevueTransfusion · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePrion Diseases and Protein Misfolding
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesEtablissement Français du SangAmorfix Life Sciences
Mots-clésPrion proteinVirologyMedicineChemistryPathologyDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: It is likely that transmission of variant Creutzfeldt-Jakob disease (vCJD) occurs by transfusion and that the candidate infectious agent (PrP(TSE)) is present in small concentrations in the blood of infected donors in the asymptomatic phase of the disease. A new blood screening assay has been developed to detect PrP(TSE) in citrated plasma samples. STUDY DESIGN AND METHODS: Three regional Blood Transfusion Establishments (ETS) in France (ETS Alsace, ETS Bourgogne Franche-Comté, and ETS Pyrénées-Méditerranée) will screen 60,000 plasma samples (20,000 in each ETS) over a time period of approximately 9 to 12 months. RESULTS: Results provided in this report are those of the first testing site in Strasbourg, Alsace. The preliminary results have demonstrated an initial specificity of 97.60%. Upon repeat testing the specificity rate achieved 99.90% (20 repeat-positive samples). Based on the known epidemiology of vCJD in France, it is likely that the repeat-reactive samples are not true-positives. CONCLUSION: The screening assay was studied in terms of specificity and practicality and was found to be suitable for use in routine testing of blood donations. However, throughput must be enhanced by automation of the assay, and traceability would be improved if automated systems were used to distribute and identify samples.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,150
Score d'incertitude au seuil0,539

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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