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Enregistrement W2101858039 · doi:10.1111/j.1365-294x.2009.04433.x

Relatedness of<i>Macrophomina phaseolina</i>isolates from tallgrass prairie, maize, soybean and sorghum

2009· article· en· W2101858039 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueMolecular Ecology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Disease Management Techniques
Établissements canadiensAgriculture Food and Rural Development
Organismes subventionnairesUnited States Agency for International DevelopmentNational Institutes of HealthNational Science Foundation
Mots-clésMacrophomina phaseolinaBiologySorghumAgronomyPopulationCropEragrostisBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Agricultural and wild ecosystems may interact through shared pathogens such as Macrophomina phaseolina, a generalist clonal fungus with more than 284 plant hosts that is likely to become more important under climate change scenarios of increased heat and drought stress. To evaluate the degree of subdivision in populations of M. phaseolina in Kansas agriculture and wildlands, we compared 143 isolates from maize fields adjacent to tallgrass prairie, nearby sorghum fields, widely dispersed soybean fields and isolates from eight plant species in tallgrass prairie. Isolate growth phenotypes were evaluated on a medium containing chlorate. Genetic characteristics were analysed based on amplified fragment length polymorphisms and the sequence of the rDNA-internal transcribed spacer (ITS) region. The average genetic similarity was 58% among isolates in the tallgrass prairie, 71% in the maize fields, 75% in the sorghum fields and 80% in the dispersed soybean fields. The isolates were divided into four clusters: one containing most of the isolates from maize and soybean, two others containing isolates from wild plants and sorghum, and a fourth containing a single isolate recovered from Solidago canadensis in the tallgrass prairie. Most of the sorghum isolates had the dense phenotype on media containing chlorate, while those from other hosts had either feathery or restricted phenotypes. These results suggest that the tallgrass prairie supports a more diverse population of M. phaseolina per area than do any of the crop species. Subpopulations show incomplete specialization by host. These results also suggest that inoculum produced in agriculture may influence tallgrass prairie communities, and conversely that different pathogen subpopulations in tallgrass prairie can interact there to generate 'hybrids' with novel genetic profiles and pathogenic capabilities.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,828
Score d'incertitude au seuil0,321

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,202
Écart entre enseignants0,197 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle