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Enregistrement W2101941027 · doi:10.1097/sla.0000000000001054

Unique Tracheal Fluid MicroRNA Signature Predicts Response to FETO in Patients With Congenital Diaphragmatic Hernia

2015· article· en· W2101941027 sur OpenAlexafffund
Patrícia Pereira‐Terra, Jan Deprest, Ramin Kholdebarin, Naghmeh Khoshgoo, Philip DeKoninck, À. Munck, Jinxia Wang, Fuqin Zhu, Robbert J. Rottier, Barbara Iwasiow, Jorge Correia‐Pinto, Dick Tibboel, Martin Post, Richard Keijzer

Notice bibliographique

RevueAnnals of Surgery · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCongenital Diaphragmatic Hernia Studies
Établissements canadiensChildren's Hospital Research Institute of Manitoba
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésCongenital diaphragmatic herniaMedicineAmniotic fluidPathologyFetusLungPulmonary hypoplasiaIn situ hybridizationReal-time polymerase chain reactionmicroRNASMADImmunohistochemistryAndrologyGene expressionTransforming growth factorBiologyInternal medicinePregnancyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE AND BACKGROUND: Our objective was to determine the fetal in vivo microRNA signature in hypoplastic lungs of human fetuses with severe isolated congenital diaphragmatic hernia (CDH) and changes in tracheal and amniotic fluid of fetuses undergoing fetoscopic endoluminal tracheal occlusion (FETO) to reverse severe lung hypoplasia due to CDH. METHODS: We profiled microRNA expression in prenatal human lungs by microarray analysis. We then validated this signature with real-time quantitative polymerase chain reaction in tracheal and amniotic fluid of CDH patients undergoing FETO. We further explored the role of miR-200b using semiquantitative in situ hybridization and immunohistochemistry for TGF-β2 in postnatal lung sections. We investigated miR-200b effects on TGF-β signaling using a SMAD-luciferase reporter assay and Western blotting for phospho-SMAD2/3 and ZEB-2 in cultures of human bronchial epithelial cells. RESULTS: CDH lungs display an increased expression of 2 microRNAs: miR-200b and miR-10a as compared to control lungs. Fetuses undergoing FETO display increased miR-200 expression in their tracheal fluid at the time of balloon removal. Future survivors of FETO display significantly higher miR-200 expression than those with a limited response. miR-200b was expressed in bronchial epithelial cells and vascular endothelial cells. TGF-β2 expression was lower in CDH lungs. miR-200b inhibited TGF-β-induced SMAD signaling in cultures of human bronchial epithelial cells. CONCLUSIONS: Human fetal hypoplastic CDH lungs have a specific miR-200/miR-10a signature. Survival after FETO is associated with increased miR-200 family expression. miR-200b overexpression in CDH lungs results in decreased TGF-β/SMAD signaling.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,062
Score d'incertitude au seuil0,980

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,094
Tête enseignante GPT0,305
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations80
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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