In situ molecular detection of some white-rot and brown-rot basidiomycetes infecting temperate and tropical woods
Notice bibliographique
Résumé
Wood-decay white-rot and brown-rot fungi have a major economic impact on commercial and manufactured tropical and temperate woods. The aim of this study was to design a molecular method, coupled with polymerase chain reaction (PCR) and DNA sequencing, to enable early identification of various forms of fungal decay in various types of wood. The resulting tool could be used to certify the healthiness of commercial woods and also to make more efficient use of chemicals and thus reduce their negative environmental impact. Sapwood plates of Distemonanthus benthamianus,Fagus sylvatica, Lophira alata, Pinus sylvestris, and Pycnanthus angolensis were incubated in vitro in the presence of Fibroporia vaillantii, Coniophora puteana, Gloeophyllum trabeum, Pycnoporus sanguineus, and Trametes versicolor according to the EN 113 standard method. Average mass losses ranging from 2.6% to 25.0% indicated that all wood samples had been actually infected and enabled us to test the reliability of our method. PCR products were obtained in 24 of 25 combinations, and DNA sequences were obtained in 21 of the 24 fungal PCR products. DNA sequences obtained from infected wood were compared with sequences from pure strains, thus confirming the identity of the infecting strains with 100% similarity for an average of 412 bp.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».