Effect of Carbohydrate Composition in Barley and Oat Cultivars on Microbial Ecophysiology and Proliferation of <i>Salmonella enterica</i> in an In Vitro Model of the Porcine Gastrointestinal Tract
Notice bibliographique
Résumé
The influence of the carbohydrate (CHO) composition of cereal cultivars on microbial ecophysiology was studied using an in vitro model of the porcine gastrointestinal tract. Ten hull-less barley cultivars, six barley cultivars with hulls, six oat cultivars, and six oat groats that differed in beta-glucan, nonstarch polysaccharide (NSP), and starch contents and starch type were hydrolyzed enzymatically and incubated for 72 h with pig feces. Fermentation kinetics were modeled, and microbial compositions and short-chain fatty acid (SCFA) profiles were analyzed using terminal restriction fragment length polymorphism and gas chromatography. Cluster analysis and canonical ordination revealed different effects on fermentation and microbial ecology depending on the type of CHO and cultivar. First, in cultivars of barley with hulls and oats, the cellulose and insoluble NSP contents (i) increased Ruminococcus flavefaciens-like and Clostridium xylanolyticum-like phylotypes, (ii) increased acetate production, and (iii) decreased fermentation activity. Second, in hull-less barley cultivars the beta-glucan, amylose, amylopectin, crude protein, and soluble NSP contents determined the microbial community composition and activity as follows: (i) the amylose contents of the hull-less barley varieties increased the butyrate production and the abundance of Clostridium butyricum-like phylotypes, (ii) the beta-glucan content determined the total amounts of SCFA, and (iii) the amylopectin and starch contents affected the abundance of Clostridium ramosum-like phylotypes, members of Clostridium cluster XIVa, and Bacteroides-like bacteria. Finally, the effect of CHO on proliferation of Salmonella enterica in the model was determined. Salmonella cell counts were not affected, but the relative proportion of Salmonella decreased with hull-less barley cultivars and increased with oat cultivars as revealed by quantitative PCR. Our results shed light on the complex interactions of cereal CHO with intestinal bacterial ecophysiology and the possible impact on host health.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».