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Enregistrement W2101979622 · doi:10.1373/clinchem.2011.165191

Novel Loss-of-Function PCSK9 Variant Is Associated with Low Plasma LDL Cholesterol in a French-Canadian Family and with Impaired Processing and Secretion in Cell Culture

2011· article· en· W2101979622 sur OpenAlexafffundabout
Janice Mayne, Thilina Dewpura, Angela Raymond, Lise Bernier, Marion Cousins, Teik Chye Ooi, Jean Davignon, Nabil G. Seidah, Majambu Mbikay, Michel Chrétien

Notice bibliographique

RevueClinical Chemistry · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLipoproteins and Cardiovascular Health
Établissements canadiensOttawa HospitalMontreal Clinical Research InstituteUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchFondation Jean-Louis LévesqueAstraZenecaPfizer
Mots-clésPCSK9SecretionInternal medicineCholesterolFunction (biology)EndocrinologyLdl cholesterolKexinLDL receptorMedicineBiologyGeneticsLipoprotein

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: PCSK9 (proprotein convertase subtilisin/kexin type 9) is a polymorphic gene whose protein product regulates plasma LDL cholesterol (LDLC) concentrations by shuttling liver LDL receptors (LDLRs) for degradation. PCSK9 variants that cause a gain or loss of PCSK9 function are associated with hyper- or hypocholesterolemia, which increases or reduces the risk of cardiovascular disease, respectively. We studied the clinical and molecular characteristics of a novel PCSK9 loss-of-function sequence variant in a white French-Canadian family. METHODS: In vivo plasma and ex vivo secreted PCSK9 concentrations were measured with a commercial ELISA. We sequenced the PCSK9 exons for 15 members of a family, the proband of which exhibited very low plasma PCSK9 and LDLC concentrations. We then conducted a structure/function analysis of the novel PCSK9 variant in cell culture to identify its phenotypic basis. RESULTS: We identified a PCSK9 sequence variant in the French-Canadian family that produced the PCSK9 Q152H substitution. Family members carrying this variant had mean decreases in circulating PCSK9 and LDLC concentrations of 79% and 48%, respectively, compared with unrelated noncarriers (n=210). In cell culture, the proPCSK9-Q152H variant did not undergo efficient autocatalytic cleavage and was not secreted. Cells transiently transfected with PCSK9-Q152H cDNA had LDLR concentrations that were significantly higher than those of cells overproducing wild-type PCSK9 (PCSK9-WT). Cotransfection of PCSK9-Q152H and PCSK9-WT cDNAs produced a 78% decrease in the secreted PCSK9-WT protein compared with control cells. CONCLUSIONS: Collectively, our results demonstrate that the PCSK9-Q152H variant markedly lowers plasma PCSK9 and LDLC concentrations in heterozygous carriers via decreased autocatalytic processing and secretion, and hence, inactivity on the LDLR.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,423
Score d'incertitude au seuil0,841

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0030,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations109
Publié2011
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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