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Enregistrement W2102228144 · doi:10.1093/toxsci/kfp267

Creation of a Hyperpermeable Yeast Strain to Genotoxic Agents through Combined Inactivation of PDR and CWP Genes

2009· article· en· W2102228144 sur OpenAlexaff
Min Zhang, Michelle Hanna, Jia Li, Susan Butcher, Heping Dai, Wei Xiao

Notice bibliographique

RevueToxicological Sciences · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA Repair Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGenotoxicityYeastMutantEffluxDNA damageGeneSaccharomyces cerevisiaeAmes testBiologyDNA repairMutationChemistryDNAMolecular biologyBiochemistryGeneticsToxicityBacteriaSalmonella

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We previously established a genotoxicity detection system based on the transcriptional response of the yeast RNR3 gene to DNA damage. In order to further improve its sensitivity to genotoxicants, we have attempted to increase cell permeability by removing cell wall mannoproteins (CWPs). Here, we report that selected deletion of pleiotropic drug resistance (PDR) genes encoding membrane efflux transporters also enhanced cellular sensitivity to treatment by various genotoxic agents. Furthermore, we have validated our hypothesis that PDR and CWP protect cells through different mechanisms by demonstrating that simultaneous inactivation of the above two pathways resulted in a synergistic enhancement of assay sensitivity as measured by RNR3-lacZ expression and that this effect is at the cell permeability level. The quadruple mutation results in RNR3-lacZ assay sensitivity to tested chemicals that apparently surpasses the industry standard Ames test. We argue that this hyperpermeable yeast mutant strain would be suitable for other chemical-based genotoxic assays.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,067
Score d'incertitude au seuil0,219

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,306
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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