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Enregistrement W2102489984 · doi:10.1111/j.1365-2567.2010.03335.x

Osteopontin is up-regulated and associated with neutrophil and macrophage infiltration in glioblastoma

2010· article· en· W2102489984 sur OpenAlexaff
Nadia A. Atai, Manju Bansal, Cheungh Lo, Joost Bosman, Wikky Tigchelaar, Klazien S. Bosch, Ard Jonker, Philip C. De Witt Hamer, Dirk Troost, Christopher A. McCulloch, Vincent Everts, Cornelis J.F. Van Noorden, Jaro Sodek

Notice bibliographique

RevueImmunology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBone and Dental Protein Studies
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOsteopontinBiologyInfiltration (HVAC)Cancer researchGliomaCancerCancer cellPathologyGene signatureExtracellularIn vitroImmunologyGeneGene expressionMedicineCell biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Osteopontin (OPN) is a glycophosphoprotein with multiple intracellular and extracellular functions. In vitro, OPN enhances migration of mouse neutrophils and macrophages. In cancer, extracellular OPN facilitates migration of cancer cells via its RGD sequence. The present study was designed to investigate whether osteopontin is responsible for neutrophil and macrophage infiltration in human cancer and in particular in glioblastoma. We found that in vitro mouse neutrophil migration was RGD-dependent. In silico, we found that the OPN gene was one of the 5% most highly expressed genes in 20 out of 35 cancer microarray data sets in comparison with normal tissue in at least 30% of cancer patients. In some types of cancer, such as ovarian cancer, lung cancer and melanoma, the OPN gene was one of those with the highest expression levels in at least 90% of cancer patients. In glioblastoma, the most invasive type of brain tumours/glioma, but not in lower grades of glioma it was one of the 5% highest expressed genes in 90% of patients. In situ, we found increased protein levels of OPN in human glioblastoma versus normal human brain confirming in silico results. OPN protein expression was co-localized with neutrophils and macrophages. In conclusion, OPN in tumours not only induces migration of cancer cells but also of leucocytes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations93
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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