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Enregistrement W2102508049 · doi:10.1177/1535370213514322

Targeting the Wnt pathway in zebrafish as a screening method to identify novel therapeutic compounds

2014· article· en· W2102508049 sur OpenAlexafffund
Joshua K. Robertson, Kestral Danzmann, Sherise Charles, Katherine Blake, Annia Olivares, Solape Bamikole, Meghan Olson, Terence J. Van Raay

Notice bibliographique

RevueExperimental Biology and Medicine · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueWnt/β-catenin signaling in development and cancer
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaChina Scholarship CouncilOntario Institute for Cancer Research
Mots-clésWnt signaling pathwayZebrafishPhenotypic screeningPhenotypeSmall moleculeBiologySignal transductionKinaseComputational biologyCancer researchCell biologyBioinformaticsGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Activating mutations in the Wnt signaling pathway account for the initiation of greater than 90% of all colorectal cancers and this pathway has been implicated in numerous other diseases. Therefore, identifying small molecule inhibitors of this pathway is of critical importance towards identifying clinically relevant drugs. Numerous screens have been employed to identify therapeutic reagents, but none have made it to advanced clinical trials, suggesting that traditional screening methods are ineffective at identifying clinically relevant targets. Here, we describe a novel in vivo screen to identify small molecule inhibitors of the Wnt pathway. Specifically, treatment of zebrafish embryos with LiCl inhibits GSK3 kinase function, resulting in hyperactivation of the signaling pathway and an eyeless phenotype at 1 day post fertilization. Using the small molecule XAV939, a known inhibitor of Wnt signaling, we rescued the LiCl induced eyeless phenotype, confirming efficacy of the screen. We next tested our assay with 400 known small molecule kinase inhibitors, none of which should inhibit Wnt signaling below the level of GSK3 based on their known targets. Accordingly, none of these small molecules rescued the eyeless phenotype, which demonstrates the stringency of the assay. However, several of these small molecule kinase inhibitors did generate a non-Wnt phenotype in accordance with the kinase they targeted. Therefore, combining the efficacy, sensitivity, and stringency of this preliminary screen, this model will provide an alternative to the traditional in vitro screen, generating potentially clinical relevant drugs in a rapid and cost-effective way.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,075
Score d'incertitude au seuil0,413

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,359
Écart entre enseignants0,336 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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