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Enregistrement W2102548388 · doi:10.1128/jvi.75.22.10892-10905.2001

Broadly Neutralizing Antibodies Targeted to the Membrane-Proximal External Region of Human Immunodeficiency Virus Type 1 Glycoprotein gp41

2001· article· en· W2102548388 sur OpenAlexfundno aff
Michael B. Zwick, Aran F. Labrijn, Meng Wang, Catherine Spenlehauer, Erica Ollmann Saphire, James Μ. Binley, John P. Moore, Gabriela Stiegler, Hermann Katinger, Dennis R. Burton, Paul W.H.I. Parren

Notice bibliographique

RevueJournal of Virology · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Center for Research ResourcesNational Institute of General Medical SciencesNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaDeutsches KrebsforschungszentrumNational Institutes of HealthHearst Foundations
Mots-clésEpitopeGp41Monoclonal antibodyBiologyVirologyGlycoproteinLinear epitopeAntibodyEpitope mappingMolecular biologyConformational epitopeNeutralizing antibodyVirusRecombinant DNABiochemistryImmunologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The identification and epitope mapping of broadly neutralizing anti-human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) antibodies (Abs) is important for vaccine design, but, despite much effort, very few such Abs have been forthcoming. Only one broadly neutralizing anti-gp41 monoclonal Ab (MAb), 2F5, has been described. Here we report on two MAbs that recognize a region immediately C-terminal of the 2F5 epitope. Both MAbs were generated from HIV-1-seropositive donors, one (Z13) from an antibody phage display library, and one (4E10) as a hybridoma. Both MAbs recognize a predominantly linear and relatively conserved epitope, compete with each other for binding to synthetic peptide derived from gp41, and bind to HIV-1(MN) virions. By flow cytometry, these MAbs appear to bind relatively weakly to infected cells and this binding is not perturbed by pretreatment of the infected cells with soluble CD4. Despite the apparent linear nature of the epitopes of Z13 and 4E10, denaturation of recombinant envelope protein reduces the binding of these MAbs, suggesting some conformational requirements for full epitope expression. Most significantly, Z13 and 4E10 are able to neutralize selected primary isolates from diverse subtypes of HIV-1 (e.g., subtypes B, C, and E). The results suggest that a rather extensive region of gp41 close to the transmembrane domain is accessible to neutralizing Abs and could form a useful target for vaccine design.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,297
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations782
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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