Genetic Interactions of <i>Arabidopsis thaliana Damaged DNA Binding Protein 1B</i> (<i>DDB1B</i>) With <i>DDB1A</i>, <i>DET1</i>, and <i>COP1</i>
Notice bibliographique
Résumé
Damaged DNA Binding protein 1 (DDB1)-CULLIN4 E3 ubiquitin ligase complexes have been implicated in diverse biological processes in a range of organisms. Arabidopsis thaliana encodes two homologs of DDB1, DDB1A, and DDB1B. In this study we use a viable partial loss of function allele of DDB1B, ddb1b-2, to examine genetic interactions with DDB1A, DET1 and COP1. Although the ddb1b-2 ddb1a double mutant is lethal, ddb1a ddb1b-2/+ and ddb1b-2 ddb1a/+ heterozygotes exhibit few developmental phenotypes but do exhibit decreased tolerance of ultraviolet light. In addition, germination in ddb1a and ddb1a ddb1b-2/+ was found to be sensitive to salt and mannitol, and both DDB1 single mutants as well as the heterozygotes exhibited heat sensitivity. DE-ETIOLATED1 (DET1) and CONSTITUTIVE PHOTOMORPHOGENIC1 (COP1) are negative regulators of light development which interact with DDB1-CUL4 complexes. Although ddb1a strongly enhances det1 phenotypes in both dark- and light-grown seedlings, ddb1b-2 weakly enhanced the det1 short hypocotyl phenotype in the dark, as well as enhancing anthocyanin levels and suppressing the det1 low chlorophyll phenotype in light-grown seedlings. In adults, ddb1a suppresses det1 early flowering and enhances the det1 dwarf phenotype. A similar trend was observed in ddb1b-2 det1 double mutants, although the effects were smaller in magnitude. In cop1 mutants, ddb1b-2 enhanced the cop1-4 short hypocotyl phenotype in dark and light, enhanced anthocyanin levels in cop1-1 in the light, but had no effect in adults. Thus the requirement for DDB1B varies in the course of development, from COP1-specific effects in hypocotyls to DET1-specific in adults.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».