Trichothecene genotypes of <i>Gibberella zeae</i> from winter wheat fields in the eastern USA
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Notice bibliographique
Résumé
Fusarium head blight (FHB), caused principally by Gibberella zeae ( Fusarium graminearum ), is a devastating disease of small grains such as wheat and barley worldwide. Grain infected with G. zeae may be contaminated with trichothecene mycotoxins such as deoxynivalenol (DON) and nivalenol (NIV). Strains of G. zeae that produce DON may also produce acetylated derivatives of DON: 3‐acetyl‐DON (3‐ADON) and 15‐acetyl‐DON (15‐ADON). Gradients (clines) of 3‐ADON genotypes in Canada have raised questions about the distribution of G. zeae trichothecene genotypes in wheat fields in the eastern USA. Tri3 and Tri12 genotypes were evaluated in 998 isolates of G. zeae collected from 39 winter wheat fields in New York (NY), Pennsylvania (PA), Maryland (MD), Virginia (VA), Kentucky (KY) and North Carolina (NC). Ninety‐two percent (919/998) of the isolates were 15‐ADON, 7% (69/998) were 3‐ADON, and 1% (10/998) was NIV. A phylogenetic analysis based on portions of three genes ( PHO , RED and URA ) from 23 isolates revealed two species of Fusarium ( F. graminearum sensu stricto and one isolate of F. cerealis (synonym F. crookwellense )). An increasing trend of 3‐ADON genotypes was observed from NC (south) to NY (north). Punctuated episodes of atmospheric transport may favour a higher frequency of 3‐ADON genotypes in the northeastern USA, near Canada, compared with the mid‐Atlantic states. Discoveries of the NIV genotype in NY and NC indicate the need for more intensive sampling in the surrounding regions.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle