Isolation prevalence of pulmonary non-tuberculous mycobacteria in Ontario, 1997 2003
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: The prevalence of pulmonary non-tuberculous mycobacteria (NTM) infection is reportedly increasing. A study was undertaken of the "isolation prevalence" of pulmonary NTM in Ontario, Canada between 1997 and 2003 and the frequency of pulmonary NTM "disease". METHODS: In a retrospective cohort, the "isolation prevalence" was studied by reviewing all positive NTM culture results from the Tuberculosis and Mycobacteriology Laboratory, Ministry of Health and Long-Term Care in Toronto from 1997 to 2003. This laboratory identifies at least 90% of NTM isolates in Ontario, Canada. Prevalence was compared between years using a negative binomial model. To study the frequency of "disease" (defined by American Thoracic Society criteria), the records of patients who had an isolate in 2003 and had been assessed at our hospital were reviewed. RESULTS: 22,247 pulmonary isolates were obtained from 10,231 patients. The "isolation prevalence" of all species (excluding Mycobacterium gordonae) was 9.1/100,000 in 1997, rising to 14.1/100,000 by 2003 (p<0.0001) with a mean annual increase of 8.4%. Similar increases were observed for individual species. 200 patients assessed at our institution were studied using American Thoracic Society criteria for "disease". Microbiological criteria were fulfilled by 37%. Of patients with adequate data, 74% fulfilled clinical criteria, 77% fulfilled radiological criteria and 33% fulfilled all criteria. CONCLUSIONS: The "isolation prevalence" of pulmonary NTM has significantly and rapidly increased in Ontario; a sizeable proportion of patients are likely to have "disease".
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».