Emergence of multidrug-resistant Salmonella enterica serotype 4,[5],12:i:- involving human cases in Canada: results from the Canadian Integrated Program on Antimicrobial Resistance Surveillance (CIPARS), 2003-10
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVES: Over the last decade, a marked increase in Salmonella enterica serotype 4,[5],12:i:- with a core resistance to ampicillin, streptomycin, sulphonamides and tetracycline (ASSuT) has been observed in Europe. This study describes the emergence and characterization of isolates of multidrug-resistant Salmonella 4,[5],12:i:- in Canada. METHODS: Human clinical isolates of Salmonella 4,[5],12:i:- were identified by provincial laboratories from 2003 to 2010. Serotyping and phage typing were performed by standardized methodologies. MIC values were determined using broth microdilution. PCR was used to determine the presence of resistance genes. Multilocus sequence typing was performed on a selected number of isolates. RESULTS: A total of 26 251 Salmonella were submitted as part of the Canadian Integrated Program on Antibiotic Resistance Surveillance (CIPARS). Of these, Salmonella 4,[5],12:i:- accounted for a total of 766 isolates (2.9%), and the number increased significantly from 42 (1.4%) in 2003 to 164 (4.8%) in 2010. The ASSuT+ phenotype was observed in 11.9% (n = 91) of Salmonella 4,[5],12:i:- isolates and increased from two isolates in 2003 to 35 isolates in 2010. Two sequence types (STs) were observed. ST34 was mainly associated with the ASSuT isolates (n = 24; 38%), which contained blaTEM, strA-strB, tet(B) and sul2. ST19 was more likely to be associated with the ACSSuT phenotype and contained blaTEM, floR, strA-strB, sul2 and tet(A) or blaPSE-1, floR, aadA2, sul1 and tet(G). CONCLUSIONS: The prevalence of Salmonella 4,[5],12:i:- has significantly increased from 2003 to 2010 and it is now the fifth most common serotype reported in Canada causing human disease. Similar antimicrobial resistance patterns, phage types and STs have been observed in Europe.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».