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Enregistrement W2102882196 · doi:10.1128/cvi.00139-13

Structure and Immunogenicity of the Rough-Type Lipopolysaccharide from the Periodontal Pathogen Tannerella forsythia

2013· article· en· W2102882196 sur OpenAlexaff
Gerald Posch, Oleh Andrukhov, Evgeny Vinogradov, Buko Lindner, Paul Messner, Otto Holst, Christina Schäffer

Notice bibliographique

RevueClinical and Vaccine Immunology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineDentistry
ThématiqueOral microbiology and periodontitis research
Établissements canadiensInstitute for Biological Sciences
Organismes subventionnairesUniversity of California, San FranciscoAustrian Science Fund
Mots-clésTannerella forsythiaImmunogenicityForsythiaPeriodontal pathogenPathogenLipopolysaccharideMicrobiologyVirologyMedicineImmunologyImmune systemPorphyromonas gingivalisBiologyPeriodontitisDentistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Tannerella forsythia is a Gram-negative anaerobic organism that inhabits subgingival plaque biofilms and is covered with a so far unique surface layer composed of two glycoproteins. It belongs to the so-called "red complex" of bacteria comprising species that are associated with periodontal disease. While the surface layer glycoprotein glycan structure had been elucidated recently and found to be a virulence factor, no structural data on the lipopolysaccharide (LPS) of this organism were available. In this study, the T. forsythia LPS structure was partially elucidated by a combined mass spectrometry (MS) and nuclear magnetic resonance spectroscopy (NMR) approach and initial experiments to characterize its immunostimulatory potential were performed. The T. forsythia LPS is a complex, rough-type LPS with a core region composed of one 3-deoxy-d-manno-oct-2-ulosonic acid (Kdo) residue, three mannose residues, and two glucosamine residues. MS analyses of O-deacylated LPS proved that, in addition, one phosphoethanolamine residue and most likely one galactose-phosphate residue were present, however, their positions could not be identified. Stimulation of human macrophages with T. forsythia LPS resulted in the production of the proinflammatory cytokines interleukin-1 (IL-1), IL-6, and tumor necrosis factor alpha in a dose-dependent manner. The response to T. forsythia LPS was observed only upon stimulation in the presence of fetal calf serum (FCS), whereas no cytokine production was observed in the absence of FCS. This finding suggests that the presence of certain additional cofactors is crucial for the immune response induced by T. forsythia LPS.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,240
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,300
Écart entre enseignants0,279 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations38
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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