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Enregistrement W2102901123 · doi:10.1128/mcb.00241-07

Monoubiquitylation of H2A.Z Distinguishes Its Association with Euchromatin or Facultative Heterochromatin

2007· article· en· W2102901123 sur OpenAlex
Elizabeth Sarcinella, Philip C. Zuzarte, Priscilla Nga Ieng Lau, Ryan Draker, Peter Cheung

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueMolecular and Cellular Biology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Chromatin Dynamics
Établissements canadiensUniversity of TorontoOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesNational Cancer Institute
Mots-clésEuchromatinHeterochromatinBiologyHeterochromatin protein 1ChromatinHistoneGeneticsConstitutive heterochromatinHistone H2AHistone methylationNucleosomeDNA methylationCell biologyMolecular biologyGeneGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

H2A.Z is a histone H2A variant that is essential for viability in organisms such as Tetrahymena thermophila, Drosophila melanogaster, and mice. In Saccharomyces cerevisiae, loss of H2A.Z is tolerated, but proper regulation of gene expression is affected. Genetics and genome-wide localization studies show that yeast H2A.Z physically localizes to the promoters of genes and functions in part to protect active genes in euchromatin from being silenced by heterochromatin spreading. To date, the function of H2A.Z in mammalian cells is less clear, and evidence so far suggests that it has a role in chromatin compaction and heterochromatin silencing. In this study, we found that the bulk of H2A.Z is excluded from constitutive heterochromatin in differentiated human and mouse cells. Consistent with this observation, analyses of H2A.Z- or H2A-containing mononucleosomes show that the H3 associated with H2A.Z has lower levels of K9 methylation but higher levels of K4 methylation than those associated with H2A. We also found that a fraction of mammalian H2A.Z is monoubiquitylated and that, on the inactive X chromosomes of female cells, the majority of this histone variant is modified by ubiquitin. Finally, ubiquitylation of H2A.Z is mediated by the RING1b E3 ligase of the human polycomb complex, further supporting a silencing role of ubiquitylated H2A.Z. These new findings suggest that mammalian H2A.Z is associated with both euchromatin and facultative heterochromatin and that monoubiquitylation is a specific mark that distinguishes the H2A.Z associated with these different chromatin states.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,049
Score d'incertitude au seuil0,634

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle