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Enregistrement W2102925061 · doi:10.1158/1078-0432.ccr-10-3405

The Role of <i>KRAS</i> rs61764370 in Invasive Epithelial Ovarian Cancer: Implications for Clinical Testing

2011· article· en· W2102925061 sur OpenAlexaff
Paul D.P. Pharoah, Rachel T. Palmieri, Susan J. Ramus, Simon A. Gayther, Irene L. Andrulis, Hoda Anton‐Culver, Natalia Antonenkova, Antonis C. Antoniou, David E. Goldgar, Mary Beattie, Matthias W. Beckmann, Michael J. Birrer, Natalia Bogdanova, Kelly L. Bolton, Wendy R. Brewster, Angela Brooks‐Wilson, Robert Brown, Ralf Bützow, Trinidad Caldés, Maria A. Caligo, Ian Campbell, Jenny Chang‐Claude, Y. Ann Chen, Linda S. Cook, Fergus J. Couch, Daniel W. Cramer, Julie M. Cunningham, Evelyn Despierre, Jennifer A. Doherty, Thilo Dörk, Matthias Dürst, Arif B. Ekici, Douglas F. Easton, Peter A. Fasching, Anna de Fazio, David Fenstermacher, James M. Flanagan, Brooke L. Fridley, Eitan Friedman, Bo Gao, Olga M. Sinilnikova, Aleksandra Gentry‐Maharaj, Andrew K. Godwin, Ellen L. Goode, Marc T. Goodman, Jenny Gross, Thomas van Overeem Hansen, Paul R. Harnett, Matti A. Rookus, Tuomas Heikkinen, Rebecca Hein, Claus Høgdall, Estrid Høgdall, Edwin S. Iversen, Anna Jakubowska, Sharon E. Johnatty, Beth Y. Karlan, Noah D. Kauff, Stanley B. Kaye, Georgia Chenevix‐Trench, Linda E. Kelemen, Lambertus A. Kiemeney, Susanne K. Kjær, Diether Lambrechts, James P. LaPolla, Conxi Lázaro, Nhu D. Le, Arto Leminen, Karin Leunen, Douglas A. Levine, Yi Lu, Lene Lundvall, Stuart MacGregor, Tamara Marees, Leon F.A.G. Massuger, Usha Menon, Marco Montagna, Kirsten B. Moysich, Steven A. Narod, Katherine L. Nathanson, Lotte Nedergaard, Roberta B. Ness, Heli Nevanlinna, Stefan Nickels, Ana Osório, Celeste Leigh Pearce, Catherine M. Phelan, Malcolm C. Pike, Paolo Radice, Mary Anne Rossing, Joellen M. Schildkraut, Thomas A. Sellers, Christian F. Singer, Honglin Song, Daniel O. Stram, Rebecca Sutphen, Annika Lindblom, Kathryn L. Terry, Ya-Yu Tsai, Anne M. van Altena, Ignace Vergote, Robert A. Vierkant, Allison F. Vitonis, Christine Walsh, Shan Wang‐Gohrke, Barbara Wappenschmidt, Anna H. Wu, Argyrios Ziogas, Andrew Berchuck, Harvey A. Risch

Notice bibliographique

RevueClinical Cancer Research · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueOvarian cancer diagnosis and treatment
Établissements canadiensCancer Care Ontario
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteCancer Research UKPeter MacCallum Cancer CentreWellcome TrustFriedrich-Schiller-Universität JenaMoffitt Cancer CenterUniversity of South FloridaDeutsches KrebsforschungszentrumHelsingin ja Uudenmaan SairaanhoitopiiriUniversity College LondonHelsingin Yliopisto
Mots-clésKRASOvarian cancerEpithelial ovarian cancerMedicineCancerOncologyInternal medicinePathologyGynecologyCancer researchBiologyColorectal cancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: An assay for the single-nucleotide polymorphism (SNP), rs61764370, has recently been commercially marketed as a clinical test to aid ovarian cancer risk evaluation in women with family histories of the disease. rs67164370 is in a 3'-UTR miRNA binding site of the KRAS oncogene and is a candidate for epithelial ovarian cancer (EOC) susceptibility. However, only one published article, analyzing fewer than 1,000 subjects in total, has examined this association. EXPERIMENTAL DESIGN: Risk association was evaluated in 8,669 cases of invasive EOC and 10,012 controls from 19 studies participating in the Ovarian Cancer Association Consortium, and in 683 cases and 2,044 controls carrying BRCA1 mutations from studies in the Consortium of Investigators of Modifiers of BRCA1/2. Prognosis association was also examined in a subset of five studies with progression-free survival (PFS) data and 18 studies with all-cause mortality data. RESULTS: No evidence of association was observed between genotype and risk of unselected EOC (OR = 1.02, 95% CI: 0.95-1.10), serous EOC (OR = 1.08, 95% CI: 0.98-1.18), familial EOC (OR = 1.09, 95% CI: 0.78-1.54), or among women carrying deleterious mutations in BRCA1 (OR = 1.09, 95% CI: 0.88-1.36). There was little evidence for association with survival time among unselected cases (HR = 1.10, 95% CI: 0.99-1.22), among serous cases (HR = 1.12, 95% CI = 0.99-1.28), or with PFS in 540 cases treated with carboplatin and paclitaxel (HR = 1.18, 95% CI: 0.93-1.52). CONCLUSIONS: These data exclude the possibility of an association between rs61764370 and a clinically significant risk of ovarian cancer or of familial ovarian cancer. Use of this SNP for ovarian cancer clinical risk prediction, therefore, seems unwarranted.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,259
Score d'incertitude au seuil0,868

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,534
Tête enseignante GPT0,568
Écart entre enseignants0,035 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations47
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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