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Enregistrement W2102940157 · doi:10.1093/infdis/jit482

Uropathogenic Escherichia coli Colicin-Like Usp and Associated Proteins: Their Evolution and Role in Pathogenesis

2013· letter· en· W2102940157 sur OpenAlexaff
Glen D. Armstrong

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Infectious Diseases · 2013
Typeletter
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEscherichia coli research studies
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésColicinEscherichia coliPathogenesisMicrobiologyBiologyEnterobacteriaceaeVirologyGeneticsImmunologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

(See the major article by Nipič et al on pages 1545–52.) In utero, the mammalian fetus normally develops in an environment devoid of microbial challenges. This circumstance changes, however, during and immediately following the birthing process, as the newborn infant becomes colonized by a multitude of environmental bacterial, viral, and fungal species. For the most part, however, rather than causing harm, these microorganisms begin to develop into an individual's normal microflora. Moreover, many of the body's organs such as the skin, gastrointestinal, respiratory, and genitourinary tracts, as well as both the nervous and immune systems, continue to develop after birth in close collaboration with the normal microflora [1, 2]. We now realize that normal host development and aging occur in concert with the normal microflora and vice versa and that this process is complex, involving exquisite and complex lines of communication between the host and its normal microflora [3]. Cells of the normal microflora not only receive developmental instructions from the host, but they have also established elaborate signaling pathways for communicating among themselves. These lines of communication allow the different microorganisms within the normal microflora to identify friend from foe, to defend themselves from pathogenic invaders and predatory microbes, to assist each other by providing needed metabolic products and byproducts, and to create environmental niches that favor the colonization process of each member of the community. This process is evolutionary and, under normal circumstances, will lead to a mutual coexistence of the host with its normal microflora. It may be helpful for hypothesis generation to consider the host and the normal microflora as 2 coexisting complex multicellular individuals, both of which depend on each other to maintain a state of mutual health.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,008
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,018
Score d'incertitude au seuil0,017

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,008
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0180,012
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,219
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentnon

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