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Enregistrement W2102984318 · doi:10.1093/hmg/dds555

Loci influencing blood pressure identified using a cardiovascular gene-centric array

2013· review· en· W2102984318 sur OpenAlexafffund
Santhi K. Ganesh, Vinicius Tragante, Wei Guo, Yiran Guo, Matthew B. Lanktree, Erin N. Smith, Toby Johnson, Berta Almoguera Castillo, John Barnard, Jens Baumert, Yen-Pei C. Chang, Clara C. Elbers, Martin Farrall, Mary Fischer, Nora Franceschini, Tom R. Gaunt, Johannes M.I.H. Gho, Christian Gieger, Yan Gong, Aaron Isaacs, Marcus E. Kleber, Irene Mateo Leach, Caitrin W. McDonough, Matthijs F.L. Meijs, O. MELLANDER, Cliona Molony, Ilja M. Nolte, Sandosh Padmanabhan, Ramakrishnan Rajagopalan, Jonathan A. Shaffer, Sonia Shah, Haiqing Shen, Nicole Soranzo, Peter J. van der Most, Erik P.A. van Iperen, Jessic A. Van Setten, Judith M. Vonk, Li Zhang, Amber L. Beitelshees, Gerald S. Berenson, Deepak L. Bhatt, Jolanda M.A. Boer, Eric Boerwinkle, Ben Burkley, Amber Burt, Aravinda Chakravarti, Wei Chen, Rhonda M. Cooper‐DeHoff, Sean Curtis, Albert W. Dreisbach, David Duggan, Georg Ehret, Richard R. Fabsitz, Myriam Fornage, Ervin R. Fox, Clement E. Furlong, Ron T. Gansevoort, Marten H. Hofker, G. Kees Hovingh, Susan Kirkland, Kandice Kottke‐Marchant, Abdullah Kutlar, Andrea Z. LaCroix, Taimour Langaee, Leslie A. Lange, Honghuang Lin, Kiang Liu, S. Maiwald, Rainer Malik, Gurunathan Murugesan, Christopher Newton‐Cheh, Jeffery R. O’Connell, N. Charlotte Onland‐Moret, Willem H. Ouwehand, Walter Palmas, Brenda W.J.H. Penninx, Carl J. Pepine, Mary Pettinger, Joseph F. Polak, Ramachandran S. Vasan, Jane Ranchalis, Susan Redline, Paul M. Ridker, Lynda M. Rose, Hubert Scharnag, Nicholas J. Schork, Daichi Shimbo, Alan R. Shuldiner, Sathanur R. Srinivasan, Ronald P. Stolk, Herman A. Taylor, Barbara Thorand, Mieke D. Trip, Cornelia M. van Duijn, W. M. Monique Verschuren, Cisca Wijmenga, Bernhard R. Winkelmann, Sharon B. Wyatt, J. Hunter Young, Bernhard O. Boehm, Mark J. Caulfield, Daniel I. Chasman, Karina W. Davidson, Pieter A. Doevendans, Garret A. FitzGerald, John G. Gums, Håkon Håkonarson, Hans L. Hillege, Thomas Illig, Gail P. Jarvik, Julie A. Johnson, John J.P. Kastelein, Wolfgang Köenig, Winfried März, Braxton D. Mitchell, Sarah S. Murray, Albertine J. Oldehinkel, Daniel J. Rader, Muredach P. Reilly, Alex P. Reiner, Eric E. Schadt, Roy L. Silverstein, Harold Snieder, Alice Stanton, André G. Uitterlinden, Pim van der Harst, Yvonne T. van der Schouw, Nilesh J. Samani, Andrew D. Johnson, Patricia B. Munroe, Paul I. W. de Bakker, Xiaofeng Zhu, Daniel Levy, Brendan J. Keating, Folkert W. Asselbergs

Notice bibliographique

RevueHuman Molecular Genetics · 2013
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensDalhousie UniversityWestern University
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteNational Institute on AgingMedical Research CouncilNational Institutes of HealthUniversität UlmLunds UniversitetBritish Heart FoundationBundesministerium für Bildung und ForschungHeart and Stroke Foundation of CanadaEuropean Foundation for the Study of DiabetesRijksuniversiteit GroningenUniversitair Medisch Centrum GroningenDiabetes FondsFondation LeducqMarcus och Amalia Wallenbergs minnesfondHealth and Safety ExecutiveEuropean CommissionNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesWorld Cancer Research FundUniversity of California, IrvineCase Western Reserve UniversityAmerican Heart AssociationNational Heart, Lung, and Blood InstituteKaiser Foundation Research InstituteGeorgetown UniversityBroad InstituteHigher Education AuthorityWellcome TrustUniversity of PittsburghUniversity of MinnesotaNational Center for Research ResourcesNational Institute of General Medical SciencesNierstichtingWake Forest UniversityMayo Foundation for Medical Education and ResearchNorthwestern UniversityMünchner Zentrum für GesundheitswissenschaftenUniversity of WashingtonPfizerNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekDeutsche ForschungsgemeinschaftEmory UniversityJohns Hopkins UniversityAmgenUniversity of California, DavisGeorgia Clinical and Translational Science AllianceNational Human Genome Research InstituteAgentschap NLUniversity of PennsylvaniaNational Institute of Child Health and Human DevelopmentDonald W. Reynolds FoundationNational Institute for Health and Care ResearchQueen Mary University of LondonNHS Blood and TransplantJohn D. and Catherine T. MacArthur FoundationU.S. Department of Health and Human Services
Mots-clésBiologyGeneticsGeneBlood pressureComputational biologyEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Blood pressure (BP) is a heritable determinant of risk for cardiovascular disease (CVD). To investigate genetic associations with systolic BP (SBP), diastolic BP (DBP), mean arterial pressure (MAP) and pulse pressure (PP), we genotyped ∼50 000 single-nucleotide polymorphisms (SNPs) that capture variation in ∼2100 candidate genes for cardiovascular phenotypes in 61 619 individuals of European ancestry from cohort studies in the USA and Europe. We identified novel associations between rs347591 and SBP (chromosome 3p25.3, in an intron of HRH1) and between rs2169137 and DBP (chromosome1q32.1 in an intron of MDM4) and between rs2014408 and SBP (chromosome 11p15 in an intron of SOX6), previously reported to be associated with MAP. We also confirmed 10 previously known loci associated with SBP, DBP, MAP or PP (ADRB1, ATP2B1, SH2B3/ATXN2, CSK, CYP17A1, FURIN, HFE, LSP1, MTHFR, SOX6) at array-wide significance (P < 2.4 × 10(-6)). We then replicated these associations in an independent set of 65 886 individuals of European ancestry. The findings from expression QTL (eQTL) analysis showed associations of SNPs in the MDM4 region with MDM4 expression. We did not find any evidence of association of the two novel SNPs in MDM4 and HRH1 with sequelae of high BP including coronary artery disease (CAD), left ventricular hypertrophy (LVH) or stroke. In summary, we identified two novel loci associated with BP and confirmed multiple previously reported associations. Our findings extend our understanding of genes involved in BP regulation, some of which may eventually provide new targets for therapeutic intervention.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,968
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,308
Écart entre enseignants0,265 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations158
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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