The contribution of small cryptic plasmids to the antibiotic resistance of enteropathogenic <i>Escherichia coli</i> E2348/69
Notice bibliographique
Résumé
Two uncharacterized small cryptic plasmids (SCPs) were isolated from enteropathogenic Escherichia coli strain E2348/69. Genomic DNA sequence analysis of both SCPs indicated that the smaller plasmid, p5217, encoded several mobilization genes, whereas the larger plasmid, p6148, encoded several putative antibiotic resistance determinants. Complementation analysis showed that p6148 encodes functional streptomycin resistance genes but, owing to the presence of several frameshift mutations, a nonfunctional sulfonamide resistance determinant. A plasmid similar to p6148 has previously been shown to confer a slight growth advantage on E. coli. However, we were unable to observe any significant growth advantage in different E. coli strains transformed with p6148. The p6148 DNA sequence is homologous in sequence and arrangement to DNA from other plasmid families, including large conjugative plasmids and SXT integrative and conjugative elements. This study suggests that gene clusters of the sul2-strAB antibiotic resistance genes are widespread and highly transferable, owing to their presence in a wide variety of mobile genetic elements.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».