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Enregistrement W2103336510 · doi:10.1371/journal.pgen.1000694

Meta-Analysis of the INSIG2 Association with Obesity Including 74,345 Individuals: Does Heterogeneity of Estimates Relate to Study Design?

2009· review· en· W2103336510 sur OpenAlexaff
Iris M. Heid, Cornelia Huth, Ruth J. F. Loos, Florian Kronenberg, Věra Adámková, Sonia S. Anand, Kristin Ardlie, Heike Biebermann, Peter Bjerregaard, Heiner Boeing, Claude Bouchard, Marina Ciullo, Jackie A. Cooper, Dolores Corella, Christian Dina, James C. Engert, Eva Fisher, Francesc Francès, Philippe Froguel, Johannes Hebebrand, Robert A. Hegele, Anke Hinney, Margret R. Hoehe, Frank B. Hu, Jaroslav A. Hubáček, Steve E. Humphries, Steven C. Hunt, Thomas Illig, Marjo‐Riitta Järvelin, Marika Kaakinen, Barbara Kollerits, Heiko Krude, Jitender Kumar, Leslie A. Lange, Birgit Langer, Shengxu Li, Andreas Luchner, Helen N. Lyon, Stephen Eyre, Karen L. Mohlke, Vincent Mooser, Almut Nebel, Thuy Trang Nguyen, Bernhard Paulweber, Louis Përusse, Lu Qi, Tuomo Rankinen, Dieter Rosskopf, Stefan Schreiber, Shantanu Sengupta, Rossella Sorice, Anita Suk, Guðmar Þorleifsson, Unnur Þorsteinsdóttir, Henry Völzke, Karani S. Vimaleswaran, Nicholas J. Wareham, Dawn Waterworth, Salim Yusuf, Cecilia M. Lindgren, Mark I. McCarthy, Christoph Lange, Joel N. Hirschhorn, Nan M. Laird, H.‐Erich Wichmann

Notice bibliographique

RevuePLoS Genetics · 2009
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensUniversité LavalWestern UniversityMcGill UniversityMcMaster University
Organismes subventionnairesNational Center for Research ResourcesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Heart, Lung, and Blood InstituteComisión de Investigaciones CientíficasMedical Research CouncilNational Institutes of HealthSundhed og Sygdom, Det Frie ForskningsrådExzellenzclusters EntzündungsforschungBritish Heart FoundationMinistero dell’Istruzione, dell’Università e della RicercaBundesministerium für Bildung und ForschungDeutsche ForschungsgemeinschaftBiocenter, University of OuluEuropean CommissionOulun YliopistoAcademy of Finland
Mots-clésObesityMeta-analysisOdds ratioBody mass indexPopulationDemographyBiologyGenome-wide association studyGenetic associationGenotypeInternal medicineMedicineGeneticsEndocrinologySingle-nucleotide polymorphism

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The INSIG2 rs7566605 polymorphism was identified for obesity (BMI> or =30 kg/m(2)) in one of the first genome-wide association studies, but replications were inconsistent. We collected statistics from 34 studies (n = 74,345), including general population (GP) studies, population-based studies with subjects selected for conditions related to a better health status ('healthy population', HP), and obesity studies (OB). We tested five hypotheses to explore potential sources of heterogeneity. The meta-analysis of 27 studies on Caucasian adults (n = 66,213) combining the different study designs did not support overall association of the CC-genotype with obesity, yielding an odds ratio (OR) of 1.05 (p-value = 0.27). The I(2) measure of 41% (p-value = 0.015) indicated between-study heterogeneity. Restricting to GP studies resulted in a declined I(2) measure of 11% (p-value = 0.33) and an OR of 1.10 (p-value = 0.015). Regarding the five hypotheses, our data showed (a) some difference between GP and HP studies (p-value = 0.012) and (b) an association in extreme comparisons (BMI> or =32.5, 35.0, 37.5, 40.0 kg/m(2) versus BMI<25 kg/m(2)) yielding ORs of 1.16, 1.18, 1.22, or 1.27 (p-values 0.001 to 0.003), which was also underscored by significantly increased CC-genotype frequencies across BMI categories (10.4% to 12.5%, p-value for trend = 0.0002). We did not find evidence for differential ORs (c) among studies with higher than average obesity prevalence compared to lower, (d) among studies with BMI assessment after the year 2000 compared to those before, or (e) among studies from older populations compared to younger. Analysis of non-Caucasian adults (n = 4889) or children (n = 3243) yielded ORs of 1.01 (p-value = 0.94) or 1.15 (p-value = 0.22), respectively. There was no evidence for overall association of the rs7566605 polymorphism with obesity. Our data suggested an association with extreme degrees of obesity, and consequently heterogeneous effects from different study designs may mask an underlying association when unaccounted for. The importance of study design might be under-recognized in gene discovery and association replication so far.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,063
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,080
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: Méta-analyse
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,063
Score d'incertitude au seuil0,331

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0630,080
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0140,040
Bibliométrie0,0060,007
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0050,002
Science ouverte0,0030,002
Intégrité de la recherche0,0030,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,169
Tête enseignante GPT0,365
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations76
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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