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Enregistrement W2103342907 · doi:10.1139/f08-054

Population structure of striped marlin (Kajikia audax) in the Pacific Ocean based on analysis of microsatellite and mitochondrial DNA

2008· article· en· W2103342907 sur OpenAlexvenueno aff
Jan R. McDowell, John E. Graves

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Marine Fisheries Service
Mots-clésMicrosatelliteMitochondrial DNAmtDNA control regionBiologyBiological dispersalGenetic structureAnalysis of molecular variancePopulationPhylogeographyZoologyGenetic variationEcologyEvolutionary biologyGenotypeGeneticsPhylogeneticsAlleleGeneHaplotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Genetic variation was surveyed at five microsatellite loci and the mitochondrial control region (819 bp) to test for the presence of genetic stock structure in striped marlin ( Kajikia audax ) collections taken from seven locations throughout the Pacific Ocean. Temporal replicates separated by 9 years were taken off Japan, and three temporal samples spanning 11 years were collected off the coast of eastern Australia. Analyses of multilocus microsatellite genotypes and mitochondrial control region sequences showed no significant heterogeneity among collections taken from the same location in different years; however, significant spatial genetic heterogeneity was observed across all samples for microsatellite markers (FST= 0.013, P < 0.001). Mitochondrial control region sequences were not different across all samples (ΦST= –0.01, P = 0.642). Analyses of molecular variance (AMOVA) revealed significant genetic differentiation between geographic regions for both microsatellite and mitochondrial markers. These results suggest the presence of genetically discrete populations within the Pacific Ocean and are supported by both the results of tagging studies, which show limited dispersal, and the presence of geographically separated spawning grounds.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,024

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,209
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations45
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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