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Enregistrement W2103392464 · doi:10.1186/1465-9921-9-41

Changes in elastin, elastin binding protein and versican in alveoli in chronic obstructive pulmonary disease

2008· article· en· W2103392464 sur OpenAlexaff
Mervyn J. Merrilees, Pamela ST Ching, Brent Beaumont, Aleksander Hinek, Thomas N. Wight, Peter Black

Notice bibliographique

RevueRespiratory Research · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProteoglycans and glycosaminoglycans research
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesMarsden FundNational Institutes of Health
Mots-clésVersicanElastinStainingChemistryCOPDPathologyElastic fiberProteoglycanLungExtracellular matrixMedicineBiochemistryInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: COPD is characterised by loss of alveolar elastic fibers and by lack of effective repair. Elastic fibers are assembled at cell surfaces by elastin binding protein (EBP), a molecular chaperone whose function can be reversibility inhibited by chondroitin sulphate of matrix proteoglycans such as versican. This study aimed to determine if alveoli of patients with mild to moderate COPD contained increased amounts of versican and a corresponding decrease in EBP, and if these changes were correlated with decreases in elastin and FEV1. METHODS: Lung samples were obtained from 26 control (FEV1 > or = 80% predicted, FEV1/VC >0.7) and 17 COPD patients (FEV1 > or = 40% - <80% predicted, FEV1/VC < or = 0.7) who had undergone a lobectomy for bronchial carcinoma. Samples were processed for histological and immuno-staining. Volume fractions (Vv) of elastin in alveolar walls and alveolar rims were determined by point counting, and versican and EBP assessed by grading of staining intensities. RESULTS: Elastin Vv was positively correlated with FEV1 for both the alveolar walls (r = 0.66, p < 0.001) and rims (r = 0.41, p < 0.01). Versican was negatively correlated with FEV1 in both regions (r = 0.30 and 0.32 respectively, p < 0.05), with the highest staining intensities found in patients with the lowest values for FEV1. Conversely, staining intensities for EBP in alveolar walls and rims and were positively correlated with FEV1 (r = 0.43 and 0.46, p < 0.01). CONCLUSION: Patients with mild to moderate COPD show progressively increased immuno-staining for versican and correspondingly decreased immuno-staining for EBP, with decreasing values of FEV1. These findings may explain the lack of repair of elastic fibers in the lungs of patients with moderate COPD. Removal of versican may offer a strategy for effective repair.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,059
Tête enseignante GPT0,332
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations112
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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