Hybrid zone structure and the potential role of selection in hybridizing populations of native westslope cutthroat trout (<i>Oncorhynchus clarki lewisi</i>) and introduced rainbow trout (<i>O. mykiss</i>)
Notice bibliographique
Résumé
Introgressive hybridization is a common feature of many zones of contact between divergent lineages of fishes. This is particularly common when taxa that are normally allopatric come into artificial (human-induced) secondary contact. We examined 18 native populations of westslope cutthroat trout (Oncorhynchus clarki lewisi, WCT) to determine the extent of introgressive hybridization with introduced rainbow trout (O. mykiss, RBT) and the genetic structure of hybridizing populations in the upper Kootenay River, southeastern British Columbia, Canada. Using four diagnostic nuclear loci we calculated a hybrid index, inbreeding coefficient, FIS, and the linkage disquilibrium correlation coefficient, Rij, for each locality to determine the distribution of genotypes in each population. We also categorized the 142 hybrid individuals found across localities into four hybrid classes based on their genotypes. The majority of localities (11/18) showed a unimodal distribution of genotypes skewed towards genotypes of WCT. Two localities, however (lower Gold Creek and Lodgepole Creek) showed a flat to bimodal distribution and one site (lower Bull River) showed a unimodal distribution skewed towards RBT genotypes. The majority of hybrid individuals were classified genotypically as WCT backcrosses (59%) and post-F1 individuals (24%). We found a skewed ratio of pure WCT to pure RBT (17:1) and only four F1 hybrids (3%), suggesting that the spread of RBT alleles may be facilitated by hybrids straying to neighbouring populations. We also tested for the action of selection in one population using cohort analyses, but found little evidence of differential selection between pure WCT and hybrid individuals. Pooled across age classes there were significant differences in genotypic frequencies among loci suggesting differential introgression. There was no asymmetry to the hybridization between rainbow trout and westslope cutthroat trout because both species' mitochondrial DNA haplotypes were observed at similar frequencies in the hybrids. Our analyses suggest that hybrid swarms are likely to form in the upper Kootenay River drainage and that certain native WCT populations in British Columbia are at risk of local genomic extinction.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».