Structure and Protein-Protein Interaction Studies on <i>Chlamydia trachomatis</i> Protein CT670 (YscO Homolog)
Notice bibliographique
Résumé
Comparative genomic studies have identified many proteins that are found only in various Chlamydiae species and exhibit no significant sequence similarity to any protein in organisms that do not belong to this group. The CT670 protein of Chlamydia trachomatis is one of the proteins whose genes are in one of the type III secretion gene clusters but whose cellular functions are not known. CT670 shares several characteristics with the YscO protein of Yersinia pestis, including the neighboring genes, size, charge, and secondary structure, but the structures and/or functions of these proteins remain to be determined. Although a BLAST search with CT670 did not identify YscO as a related protein, our analysis indicated that these two proteins exhibit significant sequence similarity. In this paper, we report that the CT670 crystal, solved at a resolution of 2 A, consists of a single coiled coil containing just two long helices. Gel filtration and analytical ultracentrifugation studies showed that in solution CT670 exists in both monomeric and dimeric forms and that the monomer predominates at lower protein concentrations. We examined the interaction of CT670 with many type III secretion system-related proteins (viz., CT091, CT665, CT666, CT667, CT668, CT669, CT671, CT672, and CT673) by performing bacterial two-hybrid assays. In these experiments, CT670 was found to interact only with the CT671 protein (YscP homolog), whose gene is immediately downstream of ct670. A specific interaction between CT670 and CT671 was also observed when affinity chromatography pull-down experiments were performed. These results suggest that CT670 and CT671 are putative homologs of the YcoO and YscP proteins, respectively, and that they likely form a chaperone-effector pair.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,003 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».