MOLECULAR MODELING AND STRUCTURE-BASED THERMODYNAMIC ANALYSIS OF THE StAR PROTEIN
Notice bibliographique
Résumé
Although much progress has been achieved in the study of the steroidogenic acute regulatory protein (StAR) dependent cholesterol transfer inside mitochondria, not one mechanism can account for all experimental data obtained to date. We have thus investigated the possibility that molecular modeling and structure-based thermodynamic calculations (STC) could enlighten these discrepancies. Starting from the crystallographic data of the human MLN64, a StAR homology model was generated and subjected to STC to verify the importance of StAR structural alterations for proper function. As expected, the model resembled the MLN64 crystal, although no binding site "tunnel" was obtained. Instead, a closed cavity was discovered, approximately the size and shape of cholesterol. This suggests that StAR does indeed require structural alterations to allow cholesterol binding, most evidently by the C-terminal alpha-helix above the U-shaped beta-barrel. Through STC, it is shown that unfolding of this helix is probable and leads to a 2% subpopulation of partially unfolded StAR, supportive of both the intermembrane shuttle and the molten globule hypotheses.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».