<scp>SURFACE</scp>: detecting convergent evolution from comparative data by fitting Ornstein‐Uhlenbeck models with stepwise Akaike Information Criterion
Pourquoi ce travail est-il dans la base ?
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.
Prédiction distillée sur la base complète
Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
- Catégories candidates
- aucune
- Catégories consensuelles
- aucune
- Domaine
- Signal candidat: aucuneSignal consensuel: aucune
- Devis d'étude
- Signal candidat: ObservationnelSignal consensuel: Observationnel
- Genre
- Signal candidat: EmpiriqueSignal consensuel: Empirique
- Score de désaccord entre enseignants
- 0,377
- Score d'incertitude au seuil
- 0,998
- Statut de validation
machine_predicted_unvalidated·codex-gemma-dda1882f352a
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
- Écart entre enseignants
- 0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
- Statut de validation
score_only:v0-immature-baseline· tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle
Résumé
Summary We present a method, ‘ SURFACE ’, that uses the Ornstein‐Uhlenbeck stabilizing selection model to identify cases of convergent evolution using only continuous phenotypic characters and a phylogenetic tree. SURFACE uses stepwise Akaike Information Criterion first to locate regime shifts on a tree, then to identify whether shifts are towards convergent regimes. Simulations can be used to test the hypothesis that a clade contains more convergence than expected by chance. We demonstrate the method with an application to Hawaiian Tetragnatha spiders, and present numerical simulations showing that the method has desirable statistical properties given data for multiple traits. The r package surface is available as open source software from the Comprehensive R Archive Network.
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La notice
- Revue
- Methods in Ecology and Evolution
- Thématique
- Evolution and Paleontology Studies
- Domaine
- Earth and Planetary Sciences
- Établissements canadiens
- non disponible
- Organismes subventionnaires
- Natural Sciences and Engineering Research Council of CanadaHarvard University
- Mots-clés
- Akaike information criterionConvergent evolutionConvergence (economics)Phylogenetic treeMathematicsSurface (topology)Bayesian information criterionTree (set theory)StatisticsCladeR packageSelection (genetic algorithm)Evolutionary biologyApplied mathematicsBiologyStatistical physicsComputer scienceArtificial intelligenceCombinatoricsGeneGeneticsPhysics
- Résumé présent dans OpenAlex
- oui