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Enregistrement W2103536041 · doi:10.1111/1462-2920.12643

Biodegradation of <scp>C</scp> <sub>7</sub> and <scp>C</scp> <sub>8</sub> <i>iso</i> ‐alkanes under methanogenic conditions

2014· article· en· W2103536041 sur OpenAlexafffund
Nidal Abu Laban, Anh Dao, Kathleen M. Semple, Julia M. Foght

Notice bibliographique

RevueEnvironmental Microbiology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial bioremediation and biosurfactants
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesHelmholtz-Alberta InitiativeGenome AlbertaGenome Canada
Mots-clésBiodegradationBiologyAlkaneMethanogenArchaeaFood scienceNaphthaMethaneMethanosaetaMetabolismThermophileBiochemistryEnvironmental chemistryGeneChemistryEnzymeEcologyCatalysis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Iso-alkanes comprise a substantial proportion of petroleum and refined products that impact the environment, but their fate is cryptic under methanogenic conditions. We investigated methanogenic biodegradation of C7 and C8 iso-alkanes found in naphtha, specifically 2-methylhexane, 3-methylhexane, 2-methylheptane, 4-methylheptane and 3-ethylhexane. These were incubated as a mixture or individually with enrichment cultures derived from oil sands tailings ponds that generate methane from naphtha components; substrate depletion and methane production were monitored for up to 663 days. 3-Methylhexane and 4-methylheptane were degraded both singly and in the mixture, whereas 2-methylhexane and 2-methylheptane resisted degradation as single substrates but were depleted in the iso-alkane mixture, suggesting co-metabolism. 3-Ethylhexane was degraded neither singly nor with co-substrates. Putative metabolites consistent with succinylated C7 and C8 were detected, suggesting activation by addition of iso-alkanes to fumarate and corresponding to detection of alkylsuccinate synthase-like genes. 454 pyrotag sequencing, cloning and terminal restriction fragment length polymorphism of 16S rRNA genes revealed predominance of a novel member of the family Peptococcaceae (order Clostridiales) and Archaea affiliated with Methanoregula and Methanosaeta. We report here isomer-specific metabolism of C7 -C8 iso-alkanes under methanogenic conditions and propose their activation by a novel Peptococcaceae via addition to fumarate.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,042
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,190
Écart entre enseignants0,183 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations58
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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