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Enregistrement W2103554553 · doi:10.1186/1754-6834-6-80

The development and use of an ELISA-based method to follow the distribution of cellulase monocomponents during the hydrolysis of pretreated corn stover

2013· article· en· W2103554553 sur OpenAlexafffund
Amadeus Pribowo, Jinguang Hu, Valdeir Arantes, Jack Saddler

Notice bibliographique

RevueBiotechnology for Biofuels · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueBiofuel production and bioconversion
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Renewable Energy LaboratoryNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaGenome British Columbia
Mots-clésCellulaseCorn stoverHydrolysisStoverDistribution (mathematics)Pulp and paper industryBiotechnologyCelluloseBiofuelBioenergyChemistryFood scienceAgronomyEnvironmental scienceBiologyMathematicsBiochemistryEngineering

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: It is widely recognised that fast, effective hydrolysis of pretreated lignocellulosic substrates requires the synergistic action of multiple types of hydrolytic and some non-hydrolytic proteins. However, due to the complexity of the enzyme mixture, the enzymes interaction with and interference from the substrate and a lack of specific methods to follow the distribution of individual enzymes during hydrolysis, most of enzyme-substrate interaction studies have used purified enzymes and pure cellulose model substrates. As the enzymes present in a typical "cellulase mixture" need to work cooperatively to achieve effective hydrolysis, the action of one enzyme is likely to influence the behaviour of others. The action of the enzymes will be further influenced by the nature of the lignocellulosic substrate. Therefore, it would be beneficial if a method could be developed that allowed us to follow some of the individual enzymes present in a cellulase mixture during hydrolysis of more commercially realistic biomass substrates. RESULTS: A high throughput immunoassay that could quantitatively and specifically follow individual cellulase enzymes during hydrolysis was developed. Using monoclonal and polyclonal antibodies (MAb and PAb, respectively), a double-antibody sandwich enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) was developed to specifically quantify cellulase enzymes from Trichoderma reesei: cellobiohydrolase I (Cel7A), cellobiohydrolase II (Cel6A), and endoglucanase I (Cel7B). The interference from substrate materials present in lignocellulosic supernatants could be minimized by dilution. CONCLUSION: A double-antibody sandwich ELISA was able to detect and quantify individual enzymes when present in cellulase mixtures. The assay was sensitive over a range of relatively low enzyme concentration (0 - 1 μg/ml), provided the enzymes were first pH adjusted and heat treated to increase their antigenicity. The immunoassay was employed to quantitatively monitor the adsorption of cellulase monocomponents, Cel7A, Cel6A, and Cel7B, that were present in both Celluclast and Accellerase 1000, during the hydrolysis of steam-pretreated corn stover (SPCS). All three enzymes exhibited different individual adsorption profiles. The specific and quantitative adsorption profiles observed with the ELISA method were in agreement with earlier work where more labour intensive enzyme assay techniques were used.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,218
Écart entre enseignants0,203 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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