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Enregistrement W2103673862 · doi:10.1152/ajpcell.00250.2003

Differential expression and targeting of endogenous Arf1 and Arf6 small GTPases in kidney epithelial cells in situ

2004· article· en· W2103673862 sur OpenAlexaff
Jaafar El Annan, Dennis Brown, Sylvie Breton, Sylvain Bourgoin, Dennis A. Ausiello, Vladimir Marshansky

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Physiology-Cell Physiology · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular transport and secretion
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCell biologyIntercalated CellSmall GTPaseBiologyADP ribosylation factorGTPaseImmunocytochemistryEpithelial polarityVesicleBlotGolgi apparatusCellSignal transductionEndoplasmic reticulumMembraneBiochemistryEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ADP-ribosylation factors (Arfs) are small GTPases that regulate vesicular trafficking in exo- and endocytotic pathways. As a first step in understanding the role of Arfs in renal physiology, immunocytochemistry and Western blotting were performed to characterize the expression and targeting of Arf1 and Arf6 in epithelial cells in situ. Arf1 and Arf6 were associated with apical membranes and subapical vesicles in proximal tubules, where they colocalized with megalin. Arf1 was also apically expressed in the distal tubule, connecting segment, and collecting duct (CD). Arf1 was abundant in intercalated cells (IC) and colocalized with V-ATPase in A-IC (apical) and B-IC (apical and/or basolateral). In contrast, Arf6 was associated exclusively with basolateral membranes and vesicles in the CD. In the medulla, basolateral Arf6 was detectable mainly in A-IC. Expression in principal cells became weaker throughout the outer medulla, and Arf6 was not detectable in principal cells in the inner medulla. In some kidney epithelial cells Arf1 but not Arf6 was also targeted to a perinuclear patch, where it colocalized with TGN38, a marker of the trans-Golgi network. Quantitative Western blotting showed that expression of endogenous Arf1 was 26-180 times higher than Arf6. These data indicate that Arf GTPases are expressed and targeted in a cell- and membrane-specific pattern in kidney epithelial cells in situ. The results provide a framework on which to base and interpret future studies on the role of Arf GTPases in the multitude of cellular trafficking events that occur in renal tubular epithelial cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,196
Écart entre enseignants0,189 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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