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Enregistrement W2103703179 · doi:10.1128/aem.01676-10

Class 1 Integrons, Selected Virulence Genes, and Antibiotic Resistance in <i>Escherichia coli</i> Isolates from the Minjiang River, Fujian Province, China

2010· article· en· W2103703179 sur OpenAlexafffund
Bin Chen, Weiwen Zheng, Ying Yu, Wenwen Huang, Siping Zheng, Yun Zhang, Xiong Guan, Yiting Zhuang, Ning Chen, Edward Topp

Notice bibliographique

RevueApplied and Environmental Microbiology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAntibiotic Resistance in Bacteria
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food Canada
Mots-clésIntegronVirulenceAntibiotic resistanceBiologyCiprofloxacinMicrobiologyCarriageVeterinary medicineEscherichia coliAntibioticsNorfloxacinFecesGeneGeneticsGeographyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Widespread fecal pollution of surface waters in developing countries is a threat to public health and may represent a significant pathway for the global dissemination of antibiotic resistance. The Minjiang River drainage basin in Fujian Province is one of China's most intensive livestock and poultry production areas and is home to several million people. In the study reported here, Escherichia coli isolates (n = 2,788) were sampled (2007 and 2008) from seven surface water locations in the basin and evaluated by PCR for carriage of selected genes encoding virulence factors, primarily for swine disease. A subset of isolates (n = 500) were evaluated by PCR for the distribution and characteristics of class 1 integrons, and a subset of these (n = 200) were evaluated phenotypically for resistance to a range of antibiotics. A total of 666 (24%) E. coli isolates carried at least one of the virulence genes elt, fedA, astA, fasA, estA, stx(2e), paa, and sepA. Forty-one percent of the isolates harbored class 1 integrons, and these isolates had a significantly higher probability of resistance to tobramycin, cefoperazone, cefazolin, ciprofloxacin, norfloxacin, azitromycin, and rifampin than isolates with no class 1 integron detected. Frequencies of resistance to selected antibiotics were as high as or higher than those in fecal, wastewater, and clinical isolates in published surveys undertaken in China, North America, and Europe. Overall, E. coli in the Minjiang River drainage basin carry attributes with public health significance at very high frequency, and these data provide a powerful rationale for investment in source water protection strategies in this important agricultural and urban setting in China.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,565
Score d'incertitude au seuil0,806

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,002
Tête enseignante GPT0,166
Écart entre enseignants0,164 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations73
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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