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Enregistrement W2103710604

Knockdown of chimeric glucocerebrosidase by green fluorescent protein-directed small interfering RNA.

2004· article· en· W2103710604 sur OpenAlexaff
Francis Y.M. Choy

Notice bibliographique

RevuePubMed · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Interference and Gene Delivery
Établissements canadiensUniversity of Victoria
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGlucocerebrosidaseSmall interfering RNAGene knockdownGreen fluorescent proteinGlucocerebrosideFusion proteinRNA interferenceSmall hairpin RNARNACell biologyChemistryBiologyMolecular biologyBiochemistryGeneRecombinant DNA
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Gaucher disease, the most common type of lysosomal storage disorder, is characterized by an inherited deficiency of the membrane-associated hydrolase, glucocerebrosidase. Glucocerebrosidase catalyzes the hydrolysis of glucocerebroside to ceramide and glucose, a crucial step in the recycling of membrane sphingolipids. The exorbitant cost of the current treatment standard for Gaucher disease, enzyme replacement therapy, prevents many from receiving treatment. This limitation has led to a wide-spread search for more efficient and cost-effective methods of protein production and alternate therapies, resulting in a closer examination of glucocerebrosidase biosynthesis and current treatment techniques. The use of specific small interfering RNAs (siRNAs) to knock down target genes is an attractive option for studying such processes, though a glucocerebrosidase-specific siRNA has yet to be reported. We note, however, that green fluorescent protein (GFP)-directed siRNAs can not only provide a positive control to test siRNA delivery and system integrity, but also serve as a means to knock down a fusion partner without having to design siRNAs specific to the partner. After effectively co-transfecting COS-1 cells with enhanced GFP (EGFP)-tagged glucocerebrosidase constructs and GFP-directed siRNAs, we report successful knockdown of all EGFP-containing constructs at both the RNA and protein levels. This provides a method of examining enzyme biosynthesis and treatment options. Furthermore, this technique is applicable to other systems, since we have demonstrated the usefulness of GFP as a siRNA target in mammalian cells when fused to another gene of interest.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,191
Écart entre enseignants0,181 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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