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Enregistrement W2103741676 · doi:10.1002/mrd.20947

Identification of a molecular marker for type A spermatogonia by microarray analysis using gonadal cells from p<i>vasa</i>‐<i>GFP</i> transgenic rainbow trout (<i>Oncorhynchus mykiss</i>)

2008· article· en· W2103741676 sur OpenAlex
Ayaka Yano, Kris von Schalburg, Glenn Cooper, Ben F. Koop, Goro Yoshizaki

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueMolecular Reproduction and Development · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueReproductive biology and impacts on aquatic species
Établissements canadiensUniversity of Victoria
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyRainbow troutSomatic cellGerm cellMolecular biologyCell typeTroutGreen fluorescent proteinGeneMicroarray analysis techniquesGene expressionGeneticsCellFish <Actinopterygii>Fishery

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The spermatogonia of fish can be classified as being either undifferentiated type A spermatogonia or differentiated type B spermatogonia. Although type A spermatogonia, which contain spermatogonial stem cells, have been demonstrated to be a suitable material for germ cell transplantation, no molecular markers for distinguishing between type A and type B spermatogonia in fish have been developed to date. We therefore sought to develop a molecular marker for type A spermatogonia in rainbow trout. Using GFP-dependent flow cytometry (FCM), enriched fractions of type A and type B spermatogonia, testicular somatic cells, and primordial germ cells were prepared from rainbow trout possessing the green fluorescent protein (GFP) gene driven by trout vasa regulatory regions (pvasa-GFP rainbow trout). The gene-expression profiles of each cell fraction were then compared with a microarray containing cDNAs representing 16,006 genes from several salmonid species. Genes exhibiting high expression for type A spermatogonia relative to above-mentioned other types of gonadal cells were identified and subjected to RT-PCR and quatitative PCR analysis. Since only the rainbow trout notch1 homologue showed significantly high expression in the type A spermatogonia-enriched fraction, we propose that notch1 may be a useful molecular marker for type A spermatogonia. The combination of GFP-dependent FCM and microarray analysis of pvasa-GFP rainbow trout can therefore be applied to the identification of potentially useful molecular markers of germ cells in fish.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,059
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle