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Enregistrement W2103938573 · doi:10.1128/jcm.05400-11

Comparison of the Hybrid Capture 2 and cobas 4800 Tests for Detection of High-Risk Human Papillomavirus in Specimens Collected in PreservCyt Medium

2011· article· en· W2103938573 sur OpenAlexafffundabout
Anita Wong, Jeff Fuller, Kanti Pabbaraju, Sallene Wong, George Zahariadis

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Microbiology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCervical Cancer and HPV Research
Établissements canadiensUniversity of AlbertaProvincial Laboratory of Public Health
Organismes subventionnairesAlberta InnovatesCalgary Laboratory Services
Mots-clésAscus (bryozoa)Human papillomavirusCytologyHybrid captureMedicineKappaPapillomaviridaeGynecologyGenotypingRoche DiagnosticsConfidence intervalSquamous intraepithelial lesionInternal medicineCervical intraepithelial neoplasiaGenotypeCervical cancerPathologyBiologyCancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Clinical cervical cytology specimens (n = 466) collected in PreservCyt (Hologic Inc.) were used to evaluate the agreement between Hybrid Capture 2 (hc2; Qiagen) and cobas 4800 (c4800; Roche Molecular Diagnostics) for the detection of high-risk human papillomavirus (HR HPV) genotype infections. The agreement between the two assays was 93.8% (kappa = 0.87; 95% confidence interval, 0.828 to 0.918), with 186 and 251 concordant positive and negative results, respectively. All 186 concordant positives were confirmed using the Linear Array (LA; Roche Molecular Diagnostics) genotyping test. Of the 29 samples with discordant results (6.2%), 18 were hc2 positive and LA verified 17 as positive for HR HPV. Eleven discordant specimens were c4800 positive, and LA confirmed 5 as positive for HR HPV. As of October 2009, practice guidelines in Alberta, Canada, recommend reflex HPV testing for women over 30 years old with atypical squamous cells of undetermined significance (ASCUS) and for women over 50 years old with low-grade squamous intraepithelial lesions (LSIL) to help prioritize those who should undergo further evaluation. In this study, agreement between hc2 and c4800 results for samples from women over 30 years old with ASCUS cytology was 92.3% (n = 13), while no samples from women over 50 years old with LSIL cytology were identified for analysis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,126
Score d'incertitude au seuil0,364

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,134
Tête enseignante GPT0,444
Écart entre enseignants0,311 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations43
Publié2011
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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