Influence of HLA Supertypes on Susceptibility and Resistance to Human Immunodeficiency Virus Type 1 Infection
Notice bibliographique
Résumé
Certain human leukocyte antigens, by presenting conserved immunogenic epitopes for T cell recognition, may, in part, account for the observed differences in human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) susceptibility. To determine whether HLA polymorphism influences HIV-1 susceptibility, a longitudinal cohort of highly HIV-1-exposed female sex workers based in Nairobi, Kenya, was prospectively analyzed. Decreased HIV-1 infection risk was strongly associated with possession of a cluster of closely related HLA alleles (A2/6802 supertype; incidence rate ratio [IRR], 0.45; 95% confidence interval [CI], 0.27-0.72; P=.0003). The alleles in this supertype are known in some cases to present the same peptide epitopes for T cell recognition. In addition, resistance to HIV-1 infection was independently associated with HLA DRB1*01 (IRR, 0.22; 95% CI, 0.06-0.60; P=.0003), which suggests that anti-HIV-1 class II restricted CD4 effector mechanisms may play an important role in protecting against viral challenge. These data provide further evidence that resistance to HIV-1 infection in this cohort of sex workers is immunologically mediated.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».