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Enregistrement W2103938894 · doi:10.1086/315472

Influence of HLA Supertypes on Susceptibility and Resistance to Human Immunodeficiency Virus Type 1 Infection

2000· article· en· W2103938894 sur OpenAlexafffund
Kelly S. MacDonald, Keith R. Fowke, Joshua Kimani, Viviane A. Dunand, Nico J. D. Nagelkerke, T. Blake Ball, Julius Oyugi, Ephantus Njagi, Lakshmi K. Gaur, Robert C. Brunham, Judy Wade, Mark A. Luscher, Peter Krausa, Sarah Rowland‐Jones, Elizabeth Ngugi, Job J. Bwayo, Francis A. Plummer

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Infectious Diseases · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensToronto Western HospitalToronto General HospitalUniversity of TorontoUniversity of ManitobaMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilNational Institutes of HealthNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesOntario HIV Treatment Network
Mots-clésVirologyHuman leukocyte antigenHuman immunodeficiency virus (HIV)BiologyImmunologyAntigen

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Certain human leukocyte antigens, by presenting conserved immunogenic epitopes for T cell recognition, may, in part, account for the observed differences in human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) susceptibility. To determine whether HLA polymorphism influences HIV-1 susceptibility, a longitudinal cohort of highly HIV-1-exposed female sex workers based in Nairobi, Kenya, was prospectively analyzed. Decreased HIV-1 infection risk was strongly associated with possession of a cluster of closely related HLA alleles (A2/6802 supertype; incidence rate ratio [IRR], 0.45; 95% confidence interval [CI], 0.27-0.72; P=.0003). The alleles in this supertype are known in some cases to present the same peptide epitopes for T cell recognition. In addition, resistance to HIV-1 infection was independently associated with HLA DRB1*01 (IRR, 0.22; 95% CI, 0.06-0.60; P=.0003), which suggests that anti-HIV-1 class II restricted CD4 effector mechanisms may play an important role in protecting against viral challenge. These data provide further evidence that resistance to HIV-1 infection in this cohort of sex workers is immunologically mediated.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,262 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations267
Publié2000
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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