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Enregistrement W2103963247 · doi:10.1002/jms.3706

Characterization of dehydroascorbate‐mediated modification of glutaredoxin by mass spectrometry

2015· article· en· W2103963247 sur OpenAlexafffund
Aurore Flandrin, Sebastien Allouche, Yoann Rolland, François‐Olivier McDuff, J. Richard Wagner, Klaus Klarskov

Notice bibliographique

RevueJournal of Mass Spectrometry · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineNursing
ThématiqueVitamin C and Antioxidants Research
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésChemistryGlutaredoxinCysteineAdductThiolBiochemistryMass spectrometryGlutathioneTandem mass spectrometryAntioxidantOxidative stressStereochemistryOrganic chemistryChromatographyEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Ascorbate is as a potent antioxidant in vivo protecting the organism against oxidative stress. In this process, ascorbate is oxidized in two steps to dehydroascorbate (DHA), which if not efficiently reduced back to ascorbate decomposes irreversibly to a complex mixture of products. We demonstrate that a component of this mixture specifically reacts with the thiol group of cysteine residues at physiological pH to give a protein adduct involving the addition of a 5-carbon fragment of DHA (+112 Da). Incubations of glutaredoxin-1 expressed in Escherichia coli and dehydroascorbate revealed abundant adducts of +112, +224 and +336 Da due to the addition of one, two and three conjugation products of DHA, respectively. ESI-MS of carbamidomethylated glutaredoxin-1 before incubation with DHA, deuterium exchange together with tandem mass spectrometry analysis and LC-ESIMS/MS of modified peptides confirmed structure and sites of modification in the protein. Modification of protein thiols by a DHA-derived product can be involved in oxidative stress-mediated cellular toxicity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,019
Score d'incertitude au seuil0,783

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,289
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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