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Enregistrement W2104062750

Genomic signature and toxicogenomics comparison of polycationic gene delivery nanosystems in human alveolar epithelial A549 cells

2009· article· en· W2104062750 sur OpenAlexaff
Jaleh Barar, H Hamzehei, S A Mortazavi Tabatabaei, S E Hashemi Aghdam, Yadollah Omidi

Notice bibliographique

RevueDOAJ (DOAJ: Directory of Open Access Journals) · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Interference and Gene Delivery
Établissements canadiensCentre for Drug Research and Development
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésToxicogenomicsGene deliveryA549 cellGene expressionGeneGene expression profilingDNA microarrayMolecular biologyComputational biologyChemistryPolyethylenimineComplementary DNACell biologyTransfectionBiologyApoptosisBiochemistry
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

"nBackground and the purpose of the study: Of the gene delivery systems, non-viral polycationic gene delivery nanosystems have been alternatively exploited as a relatively safe delivery reagents compared to viral vectors. However, little is known about the genomic impacts of these delivery systems in target cells/tissues. In this study, the toxicogenomics and genotoxicity potential of some selected polycationic lipid/polymer based nanostructures (i.e., Oligofectamine® (OF), starburst polyamidoamine Polyfect® (PF) and diaminobutane (DAB) dendrimers) were investigated in human alveolar epithelial A549 cells. "nMethods: To study the nature and the ontology of the gene expression changes in A549 cells upon treatment with polycationic nanostructures, MTT assay and microarray gene expression profiling methodology were employed. For microarray analysis, cyanine (Cy3/Cy5) labeled cDNA samples from treated and untreated cells were hybridized on target arrays housing 200 genes. "nResults and major conclusions: The polycationic nanosystems induced significant gene expression changes belonging to different genomic ontologies such as cell defence and apoptosis pathways. These data suggest that polycationic nanosystems can elicit multiple gene expression changes in A549 cells upon their chemical structures and interactions with cellular/subcellular components. Such impacts may interfere with the main goals of the desired genemedicine.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,092
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,097
Tête enseignante GPT0,474
Écart entre enseignants0,377 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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